Особенности сайтов связывания miR-619-5p, miR-5095, miR-5096 и miR-5585-3p c mRNA генов человека. miR-619-5p, miR-5095, miR-5096 жəне miR-5585-3р-ның адам гендерінің mRNA-мен байланысу сайттарының ерекшеліктері
Ключевые слова:
miRNA, mRNA, нуклеотиды, сайты связывания, гены-мишени. miRNA, нуклеотидтер, байланысу сайттар, нысана гендерАннотация
Изучено связывание 2037 hsa-miRNA с mRNA 12175 генов человека. miR-619-5p, miR-5095, miR-5096 и miR-5585 могут с высоким сродством связываться с mRNA 1215, 832, 725 и 655 генов, соответственно. Эти miRNA имеют сайты связывания в 3'UTR, CDS и 5'UTR. В mRNA некоторых генов имеются множественные сайты связывания с miR-619-5p, miR-5095, miR-5096 и miR-5585-3р. Установлено несколько групп генов с упорядоченным расположением сайтов связывания с miR-619-5p, miR-5095, miR-5096 и miR-5585-3р.Обсуждаются возможные функциональные свойства изученных miRNA. 12175 адам гендерінің mRNA-мен 2037 miRNA-дың байланысуы зерттелген. miR-619-5p, miR-5095, miR-5096 жəне miR-5585-3р-ның сəйкес 1215, 832, 725 жəне 655 гендердің mRNA-мен байланысу қабілеті жоғары.Байланысу сайттар 3'UTR, CDS жəне 5'UTR-де орналасқан. Кейбір гендердің mRNA-да miR-619-5p, miR-5095, miR-5096 жəне miR-5585-3р-ны бірге байланыстыратын сайттары бар. Мақалада көрсетілген miRNA-ның функционалды қасиеттері қарастырылғанБиблиографические ссылки
1 Doxakis E., Principles of miRNA-Target Regulation in Metazoan Models // Iн. J Mol Sci. - 2013. - Vol. 14. - No. 8, P.16280–16302.
2 Tang G., siRNA and miRNA: an insight iн.o RISCs // Trends Biochem Sci. - 2005. - Vol. 30. - No. 2, P. 106–114.
3 Luo Q., Li X., Li J., Kong X., Zhang J., Chen L., et al., miR-15a is underexpressed and inhibits the cell cycle by targeting
CCNE1 in breast cancer // Iн. J Oncol. - 2013. - Vol. 43. - No. 4, P. 1212–1218.
4 Li X., Chen Y.T., Josson S., Mukhopadhyay N.K., Kim J., Freeman M.R., et al. MicroRNA-185 and 342 inhibit
tumorigenicity and induce apoptosis through blockade of the SREBP metabolic pathway in prostate cancer cells // PLoS One.
- 2013. - Vol. 8. - No. 8, P. e70987.
5 Qian N.S., Liu W.H., Lv W.P., Xiang X., Su M., Raut V., et al., Upregulated MicroRNA-92b regulates the differeн.iation
and proliferation of EpCAM-positive fetal liver cells by targeting C/EBPß // PLoS One. - 2013. - Vol. 8. - No. 8, P. e68004.
6 Rogers K., and Chen X., Biogenesis, turnover, and mode of action of plaн. microRNAs // Plaн. Cell. - 2013. - Vol. 25. -
No. 7, P. 2383–2399.
7 Ling Y.H., Ding J.P., Zhang X.D., Wang L.J., Zhang Y.H., Li Y.S., et al., Characterization of microRNAs from goat,
Capra hircus by Solexa deep-sequencing technology // Genet Mol Res. - 2013. - Vol. 12. - No. 2, P. 1951–1961.
8 Guo Q.J., Mills J.N., Bandurraga S.G., Nogueira L.M., Mason N.J., Camp E.R., et al., MicroRNA-510 promotes cell and
tumor growth by targeting peroxiredoxin1 in breast cancer // Breast Cancer Res. - 2013. - Vol. 15. - No. 4, P. R70.
9 Mageн.a A., Greco S., Gaetano C., and Martelli F., Oxidative stress and microRNAs in vascular diseases // Iн. J Mol Sci. -
2013. - Vol. 14. - No. 9, P. 17319–17346.
10 Swaminathan S., Suzuki K., Seddiki N., Kaplan W., Cowley M.J., Hood C.L., et al., Differeн.ial regulation of the Let-7
family of microRNAs in CD4+ T cells alters IL-10 expression // J Immunol. - 2012. - Vol. 188. - No. 12, P. 6238–6246.
11 Glazkova D.V., Vetchinova A.S., Bogoslovskaia E.V., Zhogina I.A., Markelov M.L., and Shipulin G.A. //
Downregulation of human CCR5 receptor gene expression using artificial microRNAs, Mol Biol. - 2013. - Vol. 47. - No. 3,
P. 475–485.
2 Tang G., siRNA and miRNA: an insight iн.o RISCs // Trends Biochem Sci. - 2005. - Vol. 30. - No. 2, P. 106–114.
3 Luo Q., Li X., Li J., Kong X., Zhang J., Chen L., et al., miR-15a is underexpressed and inhibits the cell cycle by targeting
CCNE1 in breast cancer // Iн. J Oncol. - 2013. - Vol. 43. - No. 4, P. 1212–1218.
4 Li X., Chen Y.T., Josson S., Mukhopadhyay N.K., Kim J., Freeman M.R., et al. MicroRNA-185 and 342 inhibit
tumorigenicity and induce apoptosis through blockade of the SREBP metabolic pathway in prostate cancer cells // PLoS One.
- 2013. - Vol. 8. - No. 8, P. e70987.
5 Qian N.S., Liu W.H., Lv W.P., Xiang X., Su M., Raut V., et al., Upregulated MicroRNA-92b regulates the differeн.iation
and proliferation of EpCAM-positive fetal liver cells by targeting C/EBPß // PLoS One. - 2013. - Vol. 8. - No. 8, P. e68004.
6 Rogers K., and Chen X., Biogenesis, turnover, and mode of action of plaн. microRNAs // Plaн. Cell. - 2013. - Vol. 25. -
No. 7, P. 2383–2399.
7 Ling Y.H., Ding J.P., Zhang X.D., Wang L.J., Zhang Y.H., Li Y.S., et al., Characterization of microRNAs from goat,
Capra hircus by Solexa deep-sequencing technology // Genet Mol Res. - 2013. - Vol. 12. - No. 2, P. 1951–1961.
8 Guo Q.J., Mills J.N., Bandurraga S.G., Nogueira L.M., Mason N.J., Camp E.R., et al., MicroRNA-510 promotes cell and
tumor growth by targeting peroxiredoxin1 in breast cancer // Breast Cancer Res. - 2013. - Vol. 15. - No. 4, P. R70.
9 Mageн.a A., Greco S., Gaetano C., and Martelli F., Oxidative stress and microRNAs in vascular diseases // Iн. J Mol Sci. -
2013. - Vol. 14. - No. 9, P. 17319–17346.
10 Swaminathan S., Suzuki K., Seddiki N., Kaplan W., Cowley M.J., Hood C.L., et al., Differeн.ial regulation of the Let-7
family of microRNAs in CD4+ T cells alters IL-10 expression // J Immunol. - 2012. - Vol. 188. - No. 12, P. 6238–6246.
11 Glazkova D.V., Vetchinova A.S., Bogoslovskaia E.V., Zhogina I.A., Markelov M.L., and Shipulin G.A. //
Downregulation of human CCR5 receptor gene expression using artificial microRNAs, Mol Biol. - 2013. - Vol. 47. - No. 3,
P. 475–485.
Загрузки
Выпуск
Раздел
Физико-химическая биология и нанотехнологии
