микроРНК и гены, связанные с развитием атеросклероза

R. Y. Niyazova; I. V. Pinsky; S. A. Atambayeva; A. Y. Pyrkova; A. T. Ivaschenko; S. B. Labeit

Авторы

R. Y. Niyazova Научно-исследовательский институт проблем биологии и биотехнологии Казахского национального университета им. аль-Фараби, Республика Казахстан, г. Алматы
I. V. Pinsky Научно-исследовательский институт проблем биологии и биотехнологии Казахского национального университета им. аль-Фараби, Республика Казахстан, г. Алматы
S. A. Atambayeva Научно-исследовательский институт проблем биологии и биотехнологии Казахского национального университета им. аль-Фараби, Республика Казахстан, г. Алматы
A. Y. Pyrkova Казахский национальный университет им. аль-Фараби, Казахстан, г. Алматы
A. T. Ivaschenko Научно-исследовательский институт проблем биологии и биотехнологии Казахского национального университета им. аль-Фараби, Республика Казахстан, г. Алматы
S. B. Labeit Медицинский центр Университета Гейдельберга, Федеративная Республика Германия, г. Мангейм

Ключевые слова:

miRNA, mRNA, сайты связывания, гены-мишени, атеросклеороз.

Аннотация

Созданы базы данных по 212 генам и 39 микроРНК (miRNA), участвующих в развитии атеросклероза. Только miR-103a-3p имела сайт связывания в mRNA гена ADAMTS7 с величиной ΔG/ΔGm более 90% из mRNA 212 генов. 39 miRNA имели 118 сайтов связывания в mRNA генов с величиной ΔG/ΔG_mот 90 до 100%. mRNA генa IRS2 содержала сайты связывания для 17 miRNA. mRNA генов LMNA, MTHFR, F11R, LDLR имели число сайтов связывания miRNA равное 14, 11, 10 и 9, соответственно. miR-619-5p и miR-5096 имели полностью комплементарные сайты связывания в mRNA генов ADAM17 и IL18. miR-619-5p имела сайты связывания в mRNA 11 генов. miR-466 имела множественные сайты связывания в mRNA пяти генов. miR-1322 имела множественные сайты связывания в mRNA генов PDE4D и RTN3, а miR-574-5p взаимодействовала с множественными сайтами в mRNA гена PPARA. Сайты связывания miRNA в mRNA генов IL18, IL10, LDLR, BRCA1, F11R имели величину ΔG/ΔGm равную 98 – 100%. mRNA генов CDKN1C, SIRT1, TGFB1, APH1B содержали сайты связывания с энергией взаимодействия 127 – 136 kJ/mole. mRNA гена CDKN1C содержала 35 сайтов связывания miR-762 в CDS.

Биографии авторов

R. Y. Niyazova, Научно-исследовательский институт проблем биологии и биотехнологии Казахского национального университета им. аль-Фараби, Республика Казахстан, г. Алматы

Ниязова Райгуль Есенгельдиевна, к.б.н., доцент КазНУ им.аль-Фараби, кафедра биотехнологии
I. V. Pinsky, Научно-исследовательский институт проблем биологии и биотехнологии Казахского национального университета им. аль-Фараби, Республика Казахстан, г. Алматы

Пинский Илья Владимирович, магистр, стажер-исследователь НИИ проблем биологии и биотехнологии КазНУ им.аль-Фараби
S. A. Atambayeva, Научно-исследовательский институт проблем биологии и биотехнологии Казахского национального университета им. аль-Фараби, Республика Казахстан, г. Алматы

Атамбаева Шара Алпысбаевна, к.б.н., доцент КазНУ им.аль-Фараби, кафедра биотехнологии
A. Y. Pyrkova, Казахский национальный университет им. аль-Фараби, Казахстан, г. Алматы

Пыркова Анна Юрьевна, к.ф.-м.н., доцент КазНУ им.аль-Фараби, кафедра информатики
A. T. Ivaschenko, Научно-исследовательский институт проблем биологии и биотехнологии Казахского национального университета им. аль-Фараби, Республика Казахстан, г. Алматы

Иващенко Анатолий Тимофеевич, д.б.н., профессор КазНУ им.аль-Фараби, кафедра биотехнологии
S. B. Labeit, Медицинский центр Университета Гейдельберга, Федеративная Республика Германия, г. Мангейм

Лабейт З.Б., PhD Медицинский центр Университета Гейдельберга, Федеративная Республика Германия, г. Мангейм