RAPD-фингерпринтинг почвенных микромицетов.Топырақ микромицеттерінің RAPD-фингерпринтингі
58 28
Кілттік сөздер:
RAPD, праймеры, микромицеты, фингерпринтинг, праймерлер, микромицеттер, фингерпринтинг.Аннотация
Нами получены стабильные RAPD-профили для 7 изолятов почвенных микромицетов амплификацией геномной ДНК с одиночными неспецифическими праймерами. В ПЦР были применены роизвольный праймер (декамер АР3), праймер-производное от межгенного спейсерного региона (Т3В) и микросателлитный праймер (GTG)5. Четкие и воспроизводимые профили продуктов амплификации были получены для всех 7 изолятов микромицетов. Количество и размеры ампликонов имели выраженную видовую специфичность. В некоторых случаях наблюдалась и внутривидовая вариабельность. Результаты показывают оправданность применения ДНК-фингерпринтинга для маркирования и быстрой идентификации почвенных микромицетов, а также оценки их стабильности при длительном культивировании. Біз топырақ микромицеттердің 7 изолятына арналған оңашаланған спецификалық емес праимерлері бар ДНҚ амплификациялау арқылы тұрақты RAPD-профильдерін алдық. ПЦР ерікті праймер (декамер АР3), генаралық спейсер регионынан (Т3В) алынған туынды-праймер және микросателитті праймер (GTG)5 қолданылды. Микромицеттердің барлық 7 изолятына айқын және оқылатын амплификация өнімінің профильдері алынды. Ампликондардың мөлшері және саны түрлік ерекшеліктері айқын көрінді. Кейбір жағдайларда түрішілік әр түрлілік көрінді. Нәтижелер бойынша топырақ микромицеттерді таңбалауға және тез идентификациялауға қолданатын ДНК-фингерпринтинг әдісі және ұзақ уақыт культивирлесе де олардың түрақтылығын бағалау өз-өзін ақтап шықты.Библиографиялық сілтемелер
1 Ботина С.Г. Молекулярно-биологические подходы к отбору бактериальных культур при создании заквасок для биотехнологии: автореф. ... докт. биол. наук. – Москва, 2011. – 47 с.
2 Практикум по микробиологии. / Под ред. А.И. Нетрусова – М.: Академия, 2005. – С.119.
3 Fegan M., Manners J.M., Maclean D.J. Irwin J.A., Samuels K.D., Holdom D.G., Li D.P. Random amplified polymorphic DNA markers reveal a high degree of genetic diversity in the entomopathogenic fungus Metarhizium artisopliae var. anisopliae // J. Gen. Microbiol. – 1993. – Vol. 139. – P. 2075-2081.
4 Cambereri E.B., Kinsey J.A. An ultra-fast method of DNA extraction from Neurospora // Fungal Genet. Newsl. – 1993. – Vol. 40. – P. 22–23.
5 Thanos M., G. Schonian, W. Meyer C., Schweinoch, Y. Graser, T. G. Mitchell, W. Presber, H.-J. Tietz. Rapid identification of Candida species by DNA fingerprinting with PCR // J. Clin. Microbiol. – 1996. – Vol. 34. – №3. – P. 615-621.
6 Muniz M. de M., Morais E. Silva Tavares P., Meyer W, Nosanchuk J.D., Zancope-Oliveira R.M. Comparison of different DNAbased methods for molecular typing of Histoplasma capsulatum // Appl. Environ. Microbiol. – 2010. – Vol.76. – №13. – P. 4438–4447.
7 Ramachandran P., Lacher D.W., Pfeiler E.A., Elkins C.A. Development of a tiered multilocus sequence typing scheme for members of the Lactobacillus acidophilus complex // Appl. Environ. Microbiol. – 2013. – Vol. 79. – № 23. – P. 7220-7228.
2 Практикум по микробиологии. / Под ред. А.И. Нетрусова – М.: Академия, 2005. – С.119.
3 Fegan M., Manners J.M., Maclean D.J. Irwin J.A., Samuels K.D., Holdom D.G., Li D.P. Random amplified polymorphic DNA markers reveal a high degree of genetic diversity in the entomopathogenic fungus Metarhizium artisopliae var. anisopliae // J. Gen. Microbiol. – 1993. – Vol. 139. – P. 2075-2081.
4 Cambereri E.B., Kinsey J.A. An ultra-fast method of DNA extraction from Neurospora // Fungal Genet. Newsl. – 1993. – Vol. 40. – P. 22–23.
5 Thanos M., G. Schonian, W. Meyer C., Schweinoch, Y. Graser, T. G. Mitchell, W. Presber, H.-J. Tietz. Rapid identification of Candida species by DNA fingerprinting with PCR // J. Clin. Microbiol. – 1996. – Vol. 34. – №3. – P. 615-621.
6 Muniz M. de M., Morais E. Silva Tavares P., Meyer W, Nosanchuk J.D., Zancope-Oliveira R.M. Comparison of different DNAbased methods for molecular typing of Histoplasma capsulatum // Appl. Environ. Microbiol. – 2010. – Vol.76. – №13. – P. 4438–4447.
7 Ramachandran P., Lacher D.W., Pfeiler E.A., Elkins C.A. Development of a tiered multilocus sequence typing scheme for members of the Lactobacillus acidophilus complex // Appl. Environ. Microbiol. – 2013. – Vol. 79. – № 23. – P. 7220-7228.
Жүктелулер
Как цитировать
Li, K. G., Moldagulova, A. K., Bekenova, E. E., Kazybaev, A. K., Kairova, M. Z., Urazova, M. S., Shajhin, S. M., & Almagambetov, K. H. (2015). RAPD-фингерпринтинг почвенных микромицетов.Топырақ микромицеттерінің RAPD-фингерпринтингі. ҚазҰУ Хабаршысы. Биология сериясы, 60(1), 34–37. вилучено із https://bb.kaznu.kz/index.php/biology/article/view/51
Шығарылым
Бөлім
Биоинформатика, геномика и протеомика. Физико-химическая биология
