Применение молекулярных методов для идентификации молочнокислых бактерий. Сүтқышқылды бактерияларды молекулярлы әдісті қолдана отырып идентификациялау
Ключевые слова:
RAPD-ПЦР анализ, праймеры, молочнокислые бактерии, фингерпринты, праймерлер, сүтқышқылды бактериялар, фингерпринттер,Аннотация
ДНК-полиморфизмы изолятов молочнокислых бактерий (МКБ) анализировали методом RAPD – ПЦР. В качестве одиночных праймеров использовали произвольный праймер, полученный из межгенных спейсерных регионов (T3B) и микросателлитный праймер (GTG)5. Закономерности формирования характерных полос в агарозном геле после электрофореза (фингерпринты) дают основания для их использования в идентификации МКБ. Сравнение видоспецифических RAPD-ПЦР фингерпринтов, принадлежащих изолятам МКБ из продуктов питания, с фингерпринтами эталонных штаммов позволит идентифицировать микроорганизмы на уровне видов, даже если они не выявлены стандартными биохимическими методами. Анализ RAPD-ПЦР полезен для молекулярного типирования МКБ в лабораториях с относительно ограниченной технической оснащенностью. Оқшауланған СҚБ ДНК-полиморфизмін RAPD-ПЦР әдісі бойынша зерттеген. Жеке праймер ретінде генаралық спейсерлі аймақтардан (T3B) және микросателлитті праймер (GTG)5, еркін праймерлер қолданған. Электрофорез өткізгеннен кейін (фингерпринттер) агарозды гелде жолақтардың пайда болу заңдылығына байланысты оларды СҚБ идентификациялауда қолданады. Тамақ өнімдеріндегі СҚБ алынған RAPD-ПЦР фингерпринттердің түр ерекшеліктерін эталонды штаммдардың фингерпринттерімен салыстыру – түр деңгейінде микроорганизмдерді идентификациялауға мүмкіндік береді. RAPD-ПЦР анализ СҚБ молекулярлы түрін анықтауға, зертханалық база салыстырмалы түрде шектеулі болғанда өте қолайлы.Библиографические ссылки
1 Singh S., Goswami P., Singh R., Heller K.J. Application of molecular identification tools for Lactobacillus, with a focus on discrimination between closely related species: a review // LWT – Food Sci. Technol. – 2009. - Vol.42. - Р. 448– 457.
2 Kairova M., Moldagulova A. Isolation and molecular identification of lactic acid bacteria from horsemeat and homemade sour cream // J. World academy of Science, Engineering and Technology.Dubai. - 2013. – Vol.73. - P. 1220-1225.
3 Thanos M., G. Schonian, W. Meyer C., Schweinoch, Y. Graser, T. G. Mitchell, W. Presber, H.-J. Tietz. Rapid identification of Candida species by DNA fingerprinting with PCR // J. Clin. Microbiol. – 1996. – Vol. 34. – №3. – P. 615–621.
4 Wongsawad C., Wongsawad P., Chai J.Y., Anuntalabhochai S. Haplorchis taichui, Witenberg, 1930: Development of a HAT-RAPD marker for the detection of minute intestinal fluke infection // Experimental Parasitology. – 2009. - Vol. 123(2). – P. 158-161.
5 Wongsawad P. and Wongsawad C. DNA Fingerprints Of Some Heterophyid Trematodes From Adult and Metacercarial Stages In Thailand // Southeast Asian J Trop Med Public Health. - 2007. – Vol. 38. – P. 110–114.
6 Guang-Hui Du, Zhi-Qiang Zhang, Qing-Jun Li. Morphological And Molecular Evidence for Natural Hybridization In Sympatric Population Of Roscoea Humeana and R. Cautleoides (Zingiberaceae) // J Plant Res. – 2012. – Vol.125. – P. 595- 603.
7 Wongsawad C. Detection of S. Falcatus Using Hat-RAPD PCR // Southeast Asian J Trop Med Public Health. – 2011. – Vol. 42. – P. 46-52.
8 Welsh J.,. Pretzman C., Postic D., Saint Girons I., Baranton G., McClelland M. Genomic fingerprinting by arbitrarily primed polymerase chain reaction resolves Borrelia burgdorferi into three distinct phyletic groups // Int. J. Syst. Bacteriol. -1992. – Vol. 42. – Р. 370–377.
2 Kairova M., Moldagulova A. Isolation and molecular identification of lactic acid bacteria from horsemeat and homemade sour cream // J. World academy of Science, Engineering and Technology.Dubai. - 2013. – Vol.73. - P. 1220-1225.
3 Thanos M., G. Schonian, W. Meyer C., Schweinoch, Y. Graser, T. G. Mitchell, W. Presber, H.-J. Tietz. Rapid identification of Candida species by DNA fingerprinting with PCR // J. Clin. Microbiol. – 1996. – Vol. 34. – №3. – P. 615–621.
4 Wongsawad C., Wongsawad P., Chai J.Y., Anuntalabhochai S. Haplorchis taichui, Witenberg, 1930: Development of a HAT-RAPD marker for the detection of minute intestinal fluke infection // Experimental Parasitology. – 2009. - Vol. 123(2). – P. 158-161.
5 Wongsawad P. and Wongsawad C. DNA Fingerprints Of Some Heterophyid Trematodes From Adult and Metacercarial Stages In Thailand // Southeast Asian J Trop Med Public Health. - 2007. – Vol. 38. – P. 110–114.
6 Guang-Hui Du, Zhi-Qiang Zhang, Qing-Jun Li. Morphological And Molecular Evidence for Natural Hybridization In Sympatric Population Of Roscoea Humeana and R. Cautleoides (Zingiberaceae) // J Plant Res. – 2012. – Vol.125. – P. 595- 603.
7 Wongsawad C. Detection of S. Falcatus Using Hat-RAPD PCR // Southeast Asian J Trop Med Public Health. – 2011. – Vol. 42. – P. 46-52.
8 Welsh J.,. Pretzman C., Postic D., Saint Girons I., Baranton G., McClelland M. Genomic fingerprinting by arbitrarily primed polymerase chain reaction resolves Borrelia burgdorferi into three distinct phyletic groups // Int. J. Syst. Bacteriol. -1992. – Vol. 42. – Р. 370–377.
Загрузки
Выпуск
Раздел
БОТАНИКА
