RAPD-фингерпринтинг почвенных микромицетов.Топырақ микромицеттерінің RAPD-фингерпринтингі

K. G. Li; A. K. Moldagulova; E. E. Bekenova; A. K. Kazybaev; M. Zh Kairova; M. S. Urazova; S. M. Shajhin; K. H. Almagambetov

Авторы

K. G. Li РГП «Республиканская коллекция микроорганизмов» КН МОН РК,
A. K. Moldagulova РГП «Республиканская коллекция микроорганизмов» КН МОН РК
E. E. Bekenova РГП «Республиканская коллекция микроорганизмов» КН МОН РК
A. K. Kazybaev РГП «Республиканская коллекция микроорганизмов» КН МОН РК
M. Zh Kairova РГП «Национальный центр биотехнологии» КН МОН РК
M. S. Urazova РГП «Республиканская коллекция микроорганизмов» КН МОН РК
S. M. Shajhin РГП «Республиканская коллекция микроорганизмов» КН МОН РК
K. H. Almagambetov РГП «Республиканская коллекция микроорганизмов» КН МОН РК

Ключевые слова:

RAPD, праймеры, микромицеты, фингерпринтинг, праймерлер, микромицеттер, фингерпринтинг.

Аннотация

Нами получены стабильные RAPD-профили для 7 изолятов почвенных микромицетов амплификацией геномной ДНК с одиночными неспецифическими праймерами. В ПЦР были применены роизвольный праймер (декамер АР3), праймер-производное от межгенного спейсерного региона (Т3В) и микросателлитный праймер (GTG)5. Четкие и воспроизводимые профили продуктов амплификации были получены для всех 7 изолятов микромицетов. Количество и размеры ампликонов имели выраженную видовую специфичность. В некоторых случаях наблюдалась и внутривидовая вариабельность. Результаты показывают оправданность применения ДНК-фингерпринтинга для маркирования и быстрой идентификации почвенных микромицетов, а также оценки их стабильности при длительном культивировании. Біз топырақ микромицеттердің 7 изолятына арналған оңашаланған спецификалық емес праимерлері бар ДНҚ амплификациялау арқылы тұрақты RAPD-профильдерін алдық. ПЦР ерікті праймер (декамер АР3), генаралық спейсер регионынан (Т3В) алынған туынды-праймер және микросателитті праймер (GTG)5 қолданылды. Микромицеттердің барлық 7 изолятына айқын және оқылатын амплификация өнімінің профильдері алынды. Ампликондардың мөлшері және саны түрлік ерекшеліктері айқын көрінді. Кейбір жағдайларда түрішілік әр түрлілік көрінді. Нәтижелер бойынша топырақ микромицеттерді таңбалауға және тез идентификациялауға қолданатын ДНК-фингерпринтинг әдісі және ұзақ уақыт культивирлесе де олардың түрақтылығын бағалау өз-өзін ақтап шықты.