микроРНК и гены, связанные с развитием атеросклероза

R. Y. Niyazova; I. V. Pinsky; S. A. Atambayeva; A. Y. Pyrkova; A. T. Ivaschenko; S. B. Labeit

Авторлар

R. Y. Niyazova әл-Фараби атындағы Қазақ ұлттық университеттің Биология және биотехнология проблемаларының ғылыми-зерттеу институты, Қазақстан Республикасы, Алматы қ.
I. V. Pinsky әл-Фараби атындағы Қазақ ұлттық университеттің Биология және биотехнология проблемаларының ғылыми-зерттеу институты, Қазақстан Республикасы, Алматы қ.
S. A. Atambayeva әл-Фараби атындағы Қазақ ұлттық университеттің Биология және биотехнология проблемаларының ғылыми-зерттеу институты, Қазақстан Республикасы, Алматы қ.
A. Y. Pyrkova Әл-Фараби атындағы Қазақ ұлттық университеті, Қазақстан, Алматы қ.
A. T. Ivaschenko әл-Фараби атындағы Қазақ ұлттық университеттің Биология және биотехнология проблемаларының ғылыми-зерттеу институты, Қазақстан Республикасы, Алматы қ.
S. B. Labeit Гейдельберг Университетінің Медициналық орталығы, Германия Федеративтік Республикасы, г. Мангейм

Кілт сөздер:

miRNA, mRNA, байланысу сайттары, нысана-гендер, атеросклеороз.

Аңдатпа

Атеросклероздың дамуына қатысатын 212 гендер және 39 микроРНК бойынша мәліметтер базалары құрастырылған. miR-103a-3p ADAMTS7 геннің mRNAда ΔG/ΔGm 90% жоғары байланысу сайты анықталған. 39 miRNAдар үшін 118 байланысу сайттар табылған, ΔG/ΔG_m90%-дан 100%-ға дейін. IRS2 геннің mRNAда 17 miRNAдар үшін байланысу сайттар бар. LMNA, MTHFR, F11R, LDLR гендердің mRNAдағы байланысу сайттардың саны 14, 11, 10 және 9. miR-619-5p және miR-5096 ADAM17 мен IL18 гендер mRNAда толық комплементарлы байланысу сайттар бар. miR-619-5p үшін 11 гендердің mRNAда байланысу сайттары бар. miR-466 үшін бес геннің mRNA көптік байланысу сайттар бар. miR-1322 үшін PDE4D және RTN3 гендер mRNAда көптік байланысу сайттар бар, ал miR-574-5p PPARA геннің mRNAда көптік сайттармен байланысады. IL18, IL10, LDLR, BRCA1, F11R гендердің mRNAда miRNAдың байланысу сайттары үшін ΔG/ΔGm 98 – 100% тең. CDKN1C, SIRT1, TGFB1, APH1B гендердің mRNAнда байланысу энергиясы 127 – 136 kJ/mole тең байланысу сайттары бар. CDKN1C геннің mRNA CDSте miR-762 үшін 35 байланысу сайттар бар.

Автор өмірбаяндары

R. Y. Niyazova, әл-Фараби атындағы Қазақ ұлттық университеттің Биология және биотехнология проблемаларының ғылыми-зерттеу институты, Қазақстан Республикасы, Алматы қ.

Ниязова Райгуль Есенгельдиевна, к.б.н., доцент КазНУ им.аль-Фараби, кафедра биотехнологии
I. V. Pinsky, әл-Фараби атындағы Қазақ ұлттық университеттің Биология және биотехнология проблемаларының ғылыми-зерттеу институты, Қазақстан Республикасы, Алматы қ.

Пинский Илья Владимирович, магистр, стажер-исследователь НИИ проблем биологии и биотехнологии КазНУ им.аль-Фараби
S. A. Atambayeva, әл-Фараби атындағы Қазақ ұлттық университеттің Биология және биотехнология проблемаларының ғылыми-зерттеу институты, Қазақстан Республикасы, Алматы қ.

Атамбаева Шара Алпысбаевна, к.б.н., доцент КазНУ им.аль-Фараби, кафедра биотехнологии
A. Y. Pyrkova, Әл-Фараби атындағы Қазақ ұлттық университеті, Қазақстан, Алматы қ.

Пыркова Анна Юрьевна, к.ф.-м.н., доцент КазНУ им.аль-Фараби, кафедра информатики
A. T. Ivaschenko, әл-Фараби атындағы Қазақ ұлттық университеттің Биология және биотехнология проблемаларының ғылыми-зерттеу институты, Қазақстан Республикасы, Алматы қ.

Иващенко Анатолий Тимофеевич, д.б.н., профессор КазНУ им.аль-Фараби, кафедра биотехнологии
S. B. Labeit, Гейдельберг Университетінің Медициналық орталығы, Германия Федеративтік Республикасы, г. Мангейм

Лабейт З.Б., PhD Медицинский центр Университета Гейдельберга, Федеративная Республика Германия, г. Мангейм