Особенности сайтов связывания miR-1285-3p, miR-5684 и семейства miR-1273 с mRNA генов человека.miR-1285-3Р, miR-5684 жəне miR-1273 жиынтығының адам гендерінің mRNA-мен байланысу сайттарының ерекшеліктері
105 42
Ключевые слова:
miRNA, mRNA, сайты связывания, гены-мишени.miRNA, байланысу сайттар, нысана гендерАннотация
Проведен поиск сайтов связывания 2578 miRNA с 13000 mRNA генов человека с использованием программы MirTarget. В mRNA многих генов выявлены участки длиной около 100 н., содержащие упорядоченно расположенные сайты связывания семейства miR-1273, miR-1285-3р и miR-5684. Эти участки расположены в 5'UTR, CDS и 3'UTR mRNA и содержат от двух до шести упорядоченно расположенных сайтов связывания с miRNA. Сайты связывания miR-1273g-3p, miR-1273а, miR-1273c, miR-1285-3р и miR-5684 перекрывались и были расположены впереди сайтов связывания miR-1273f, miR-1273d, miR-1273e, miR-1273g-5p и miR-1273h-5p, сайты связывания которых тоже перекрывались. Обсуждается роль miRNA, имеющих упорядоченные сайты связывания, в регуляции экспрессии генов участвующих в онкогенезе 13000 адам гендерінің mRNA-да 2578 miRNA-дың байланысу сайттары MirTarget бағдарламасын қолданып зерттелген. Көп гендердің mRNA-да miR-1273 жиынтығы мен miR-5684 байланыстыратын тізбектелген 100 н.учаскілер анықталған. Байланысу сайттар mRNA-ның 3'UTR, 5'UTR жəне CDS-де орналасқан жəне miRNA-мен байланысатын екіден алтыға дейін тізбектелген сайттары бар. miR-1273g-3p, miR-1273а, miR-1273c, miR-1285-3р жəне miR-5684-ны байланыстыратын сайттар бір біреуін жабады жəне бір біреуін жабатын miR-1273f, miR-1273d, miR-1273e, miR-1273g-5p жəне miR-1273h-5p-ны байланыстыратын сайттардан кейін орналасқан.Онкогенезге қатысатын гендердің экспрессиясын реттейтін miRNA-дың ролі қарастырылғанБиблиографические ссылки
1 Lai E.C. Micro RNAs are complementary to 3'UTR sequence motifs that mediate negative post-transcriptional
regulation // Nat. Genet. - 2002. - Vol. 30. - No. 4. - P. 363-364.
2 Doxakis E. Principles of miRNA-target regulation in metazoan models // Int. J. Mol. Sci. - 2013. - Vol. 14. - No. 8. -
P. 16280-16302.
3 Zhou P., Xu W., Peng X., Luo Z., Xing Q., Chen X., et al. Large-Scale Screens of miRNA-mRNA Interactions Unveiled That the
3'UTR of a Gene Is Targeted by Multiple miRNAs // PLoS One. 2013. - Vol. 8. - No. 7. - P. e68204.
4 Hausser J., Syed A.P., Bilen B., et al. Analysis of CDS-located miRNA target sites suggests that they can effectively inhibit
translation // Genome Res. 2013. - Vol. 23. - No. 4. - P. 604-615.
5 Marín R.M., Sulc M., Vanícek J. Searching the coding region for microRNA targets // RNA. 2013. - Vol. 19. - No. 4. - P. 467-474.
6 Niemoeller O.M., Niyazi M., Corradini S., Zehentmayr F., Li M., Lauber K,. Belka C. MicroRNA expression profiles in human
cancer cells after ionizing radiation // Radiat Oncol. 2011. - Vol. 31. - No. 6. - P. 29.
7 Cazzoli R., Buttitta F., Di Nicola M., Malatesta S., Marchetti A., Rom W.N., Pass H.I. microRNAs Derived from Circulating
Exosomes as Noninvasive Biomarkers for Screening and Diagnosing Lung Cancer // J Thorac Oncol. 2013. - Vol. 8. - No. 9. - P.
1156-1162.
8 Hidaka H., Seki N., Yoshino H., Yamasaki T., Yamada Y., Nohata N., et al. Tumor suppressive microRNA-1285 regulates novel
molecular targets: aberraн.expression and functional significance in renal cell carcinoma // Oncotarget. 2012. - Vol. 3. - No. 1. - P.
44-57.
9 Chen Z.H., Zhang G.L., Li H.R., Luo J.D., Li Z.X., et al. A panel of five circulating microRNAs as potential biomarkers for
prostate cancer. Prostate. 2012. - Vol. 72:1443–1452.
10 Issabekova A. Berillo O., Regnier M., Ivashchenko A. Interactions of intergenic microRNAs with mRNAs of genes involved in
carcinogenesis // Bioinformation. 2012. - Vol. 8. - No. 11. - P. 513-518.
11 Tan K.S., Armugam A., Sepramaniam S., Lim K.Y., Setyowati K.D., et al. Expression profile of MicroRNAs in young stroke
patients // PLoS One. 2009. - Vol. 4. - No. 11. - P. e7689.
12 Tian S., Huang S., Wu S., Guo W., Li J., He X. MicroRNA-1285 inhibits the expression of p53 by directly targeting its 3′
untranslated region // Biochem. Bioph. Research Comm. 2010. - Vol. 396. - No. 2. - P. 435–439.
regulation // Nat. Genet. - 2002. - Vol. 30. - No. 4. - P. 363-364.
2 Doxakis E. Principles of miRNA-target regulation in metazoan models // Int. J. Mol. Sci. - 2013. - Vol. 14. - No. 8. -
P. 16280-16302.
3 Zhou P., Xu W., Peng X., Luo Z., Xing Q., Chen X., et al. Large-Scale Screens of miRNA-mRNA Interactions Unveiled That the
3'UTR of a Gene Is Targeted by Multiple miRNAs // PLoS One. 2013. - Vol. 8. - No. 7. - P. e68204.
4 Hausser J., Syed A.P., Bilen B., et al. Analysis of CDS-located miRNA target sites suggests that they can effectively inhibit
translation // Genome Res. 2013. - Vol. 23. - No. 4. - P. 604-615.
5 Marín R.M., Sulc M., Vanícek J. Searching the coding region for microRNA targets // RNA. 2013. - Vol. 19. - No. 4. - P. 467-474.
6 Niemoeller O.M., Niyazi M., Corradini S., Zehentmayr F., Li M., Lauber K,. Belka C. MicroRNA expression profiles in human
cancer cells after ionizing radiation // Radiat Oncol. 2011. - Vol. 31. - No. 6. - P. 29.
7 Cazzoli R., Buttitta F., Di Nicola M., Malatesta S., Marchetti A., Rom W.N., Pass H.I. microRNAs Derived from Circulating
Exosomes as Noninvasive Biomarkers for Screening and Diagnosing Lung Cancer // J Thorac Oncol. 2013. - Vol. 8. - No. 9. - P.
1156-1162.
8 Hidaka H., Seki N., Yoshino H., Yamasaki T., Yamada Y., Nohata N., et al. Tumor suppressive microRNA-1285 regulates novel
molecular targets: aberraн.expression and functional significance in renal cell carcinoma // Oncotarget. 2012. - Vol. 3. - No. 1. - P.
44-57.
9 Chen Z.H., Zhang G.L., Li H.R., Luo J.D., Li Z.X., et al. A panel of five circulating microRNAs as potential biomarkers for
prostate cancer. Prostate. 2012. - Vol. 72:1443–1452.
10 Issabekova A. Berillo O., Regnier M., Ivashchenko A. Interactions of intergenic microRNAs with mRNAs of genes involved in
carcinogenesis // Bioinformation. 2012. - Vol. 8. - No. 11. - P. 513-518.
11 Tan K.S., Armugam A., Sepramaniam S., Lim K.Y., Setyowati K.D., et al. Expression profile of MicroRNAs in young stroke
patients // PLoS One. 2009. - Vol. 4. - No. 11. - P. e7689.
12 Tian S., Huang S., Wu S., Guo W., Li J., He X. MicroRNA-1285 inhibits the expression of p53 by directly targeting its 3′
untranslated region // Biochem. Bioph. Research Comm. 2010. - Vol. 396. - No. 2. - P. 435–439.
Загрузки
Как цитировать
Atambayeva, S. A., Berillo, O. A., Ivashchenko, A. T., Pyrkova, A. Y., & Niyazova, R. Y. (2015). Особенности сайтов связывания miR-1285-3p, miR-5684 и семейства miR-1273 с mRNA генов человека.miR-1285-3Р, miR-5684 жəне miR-1273 жиынтығының адам гендерінің mRNA-мен байланысу сайттарының ерекшеліктері. Вестник КазНУ. Серия биологическая, 59(3/1), 243–247. извлечено от https://bb.kaznu.kz/index.php/biology/article/view/753
Выпуск
Раздел
Физико-химическая биология и нанотехнологии
