Множественные сайты связывания некоторых miRNA в mRNA генов человека. Кейбір miRNA-дың адам гендерінің mRNA-мен байланысатын көптік сайттары.

Авторы

  • R. Y. Niyazova Национальная нанотехнологическая лаборатория КазНУ им.аль-Фараби
  • S A. Atambayeva Национальная нанотехнологическая лаборатория КазНУ им.аль-Фараби
  • O. A. Berillo Национальная нанотехнологическая лаборатория КазНУ им.аль-Фараби
  • A. Y. Pyrkova Национальная нанотехнологическая лаборатория КазНУ им.аль-Фараби
  • A. T. Ivashchenko Национальная нанотехнологическая лаборатория КазНУ им.аль-Фараби

Ключевые слова:

miRNA, mRNA, нуклеотиды, сайты связывания, гены-мишени, нуклеотидтер, байланысу сайттар, нысана гендер.

Аннотация

Установлена структурная организация сайтов связывания miR-3960, miR-3620-5p и miR-8072 в mRNA генов человека. Выявлены участки mRNA в которых последовательно через 1-3 нуклеотидов локализованы несколько сайтов связывания miR-3960. Нуклеотидные последовательности этих участков в CDS кодируют полиаланин или полипролин. В 5’UTR и 3’UTR структурная организация сайтов связывания miRNA идентична таковой в CDS. Показано, что miR-3960, miR-3620-5p и miR-8072 могут связываться с генами, участвующими в регуляции клеточного цикла и апоптоза. Обсуждаются свойства miR-3960, miR-3620-5p и miR-8072 и их роль в развитии онкологических заболеваний. miR-3960, miR-3620-5p және miR-8072-ның адам гендерінің mRNA-мен байланысу сайттарының құрылымдық ұйымдасуы қарастырылған. MiR-3960 бірнеше байланысу сайттары 1-5 нуклеотидтен кейін орналасқан mRNA учаскілері анықталған. Бұл учаскілердің нуклеотидтік тізбектерін CDS-те полиаланин или полипролин кодтайды. 5’UTR және 3’UTR-дегі mRNA байланыстыру сайттардың құрылымдық ұйымдасуы CDS-ге тән. miR-3960, miR-3620-5p және miR-8072 жасушалық цикл мен апоптозға қатысатын гендермен байланысуы көрсетілген.miR-3960, miR-3620-5p және miR-8072 қасиеттері мен онкологиялық аурулардың пайда болуындағы ролі қарастырылған.

Библиографические ссылки

1 Hausser J., Syed A.P., Bilen B., Zavolan M. Analysis of CDS-located miRNA target sites suggests that they can effectively inhibit translation // Genome Res. – 2013. – Vol. 23. – Р. 604-615.

2 Ivashchenko A.T., Issabekova AS, Berillo O.A. miR-1279, miR-548j, miR-548m, and miR-548d-5p Binding Sites in CDSs of Paralogous and Orthologous PTPN12, MSH6, and ZEB1 Genes // Biomed Res Int.: Mol.Biol. – 2013. – Vol. 2013. – P. 1-10.

3 Berillo O., Régnier M., Ivashchenko A. Binding of intronic miRNAs with mRNAs of genes coding intronic microRNAs and proteins participating in tumourigenesis // Computers in Biology and Medicine. – 2013. – Vol.43. – Р. 1374-1381.

4 Kool E.T. Hydrogen bonding, base stacking, and steric effects in DNA replication // Annu Rev Biophys Biomol Struct. – 2001.– Vol.30. – P. 22.

5 Leontis N.B., Stombaugh J., Westhof E. The non-Watson-Crick base pairs and their associated isostericity matrices // Nucleic Acids Res. – 2002. – Vol. 30. – P. 3497–3531.

6 Ниязова Р.Е., Иващенко А.Т., Берилло О.А. и др. Особенности сайтов связывания miR-3960, miR-3620-5p и miR-8072 с mRNA генов человека // Вестник КазНУ серия биологическая. – 2013. – T. 3/1, № 59. – С. 281-285.

7 Hu R. A Runx2/miR-3960/miR-2861 regulatory feedback loop during mouse osteoblast differentiation // J Biol Chem. – 2011.– Vol. 286. – P. 12328–12339.

Загрузки

Выпуск

Раздел

Биоинформатика, геномика и протеомика. Физико-химическая биология

Наиболее читаемые статьи этого автора (авторов)

> >>