Связывание microRNA с mRNA генов рост-регулирующих транскрипционных факторов арабидопсиса, риса и кукурузы. microRNA-ның арабидопсис, күрiш жəне жүгерiнің өсудi реттейтiн транскрипция факторлары гендерінің mRNA-дарымен байланысуы

  • A. I. Sagaidak Институт проблем биологии и биотехнологии, КазНУ имени аль-Фараби
  • I. V. Pinsky Институт проблем биологии и биотехнологии, КазНУ имени аль-Фараби
  • A. T. Ivashchenko Институт проблем биологии и биотехнологии, КазНУ имени аль-Фараби
  • M. Regnier Национальный исследовательский институт информатики и автоматики
  • A. A. Bari Национальный исследовательский институт информатики и автоматики

Аннотация

Изучено взаимодействие microRNA с mRNA генов рост-регулирующих транскрипционных факторов арабидопсиса, риса и кукурузы. Установлено, что из 338 miRNA арабидопсиса только семейство ath-miR396 эффективно связывалась с mRNA GRF. Выявлено, что из 661 miRNA риса с mRNA девяти рост-регулирующих факторов с высокой специфичностью связывались все девять членов семейства osa-miR396. Установлено, что из 321 miRNA кукурузы с mRNA 36 рост-регулирующих факторов кукурузы с высокой специфичностью
связывались все восемь членов семейства zma-miR396.

Арабидопсис, күрiш жəне жүгерi microRNA-ның өсудi реттейтін транскрипция факторлар гендер mRNA-мен əрекеттесуі зерттелген. Арабидопсистың 338 miRNA арасында тек қана ath-miR396 тұқымдасының GRF mRNA-мен байланысуы анықталған. Күрiштің 661 miRNA-ның ішінде osa-miR396 тұқымдасының барлық тоғыз мүшесі тоғыз өсудi реттейтін транскрипция факторлар mRNA-мен байланысқаны анықталған. Жүгерiнiң 321 miRNA арасында zma-miR396 тұқымдасының барлық сегіз мүшесi 36 GRF mRNA-мен биiк дəрежелі ерекшелiкпен байланысуы анықталған.

Литература

1. Ding Y., Tao Y., Zhu C. Emerging roles of microRNAs in the mediation of drought stress response in plants // J. Exp. Bot. -2013. - Vol. 64. - P. 3077-3086.

2. Hwang D-G, Park J.H., Lim J.Y., Kim D., Choi Y., et al. The hot pepper (Capsicum annuum) microRNA transcriptome reveals
novel and conserved targets: a foundation for understanding microRNA functional roles in hot pepper // PLoS ONE. - 2013. - Vol. 8.
- e64238. - doi:10.1371/journal.pone.0064238.

3. Minorsky P.V. Syncytium formation by cyst nematodes: involvement of a microRNA // Plant Physiol. - 2012. - Vol. 159. - P. 1-2.

4. Hwang E.-W., Shin S.-J., Kwon H.-B. Identification of microRNAs and their putative targets that respond to drought stress in
Solanum tuberosum // J. Korean Soc. Appl. Biol. Chem. - 2011. - Vol. 54. - P. 317-324.

5. Zhang Y., Yin Z., Feng X., Shen F. Differential expression of microRNAs between 21A genetic male sterile line and its
maintainer line in cotton (Gossypium hirsutum L.) // J. of Plant Studies. - 2014. - Vol. 3. - P. 13-27.

6. Xia R., Zhu H., An Y.-G., Beers E.P., Liu Z. Apple miRNAs and tasiRNAs with novel regulatory networks // Genome Biol. -
2012. - Vol.13. - P. 47.

7. Haga N., Kato K., Murase M., Araki S., Kubo M., Demura T., Suzuki K., Muller I., Voss U., Jurgens G. et al. R1R2R3-Myb
proteins positively regulate cytokinesis through activation of KNOLLE transcription in Arabidopsis thaliana // Development. - 2007.
- Vol. 134. - P. 1101-1110.

8. Kim J.H. and Kende H.A. Transcriptional coactivator, AtGIF1, is involved in regulating leaf growth and morphology in
Arabidopsis // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. - 2004. - Vol. 101. - P. 13374-13379.

9. Kim J.H. and Lee B.H. Growth-regulating factor 4 of Arabidopsis thaliana is required for development of leaves, cotyledons, and
shoot apical meristem // J. Plant Biol. - 2006. - Vol. 49. - P.463-468.

10. Kim J.H., Choi D., Kende H. The AtGRF family of putative transcription factors is involved in leaf and cotyledon growth in
Arabidopsis // Plant J. - 2003. - Vol. 36. - P. 94-104.

11. Horiguchi G., Kim G.T. and Tsukaya H. The transcription factor AtGRF5 and the transcription coactivator AN3 regulate cell
proliferation in leaf primordia of Arabidopsis thaliana // Plant J. - 2005. - Vol. 43. - P. 68-78.

12. Rodriguez R.E., Mecchia M.A., Debernardi J.M., Schommer C., Weigel D., Palatnik J.F. Control of cell proliferation in
Arabidopsis thaliana by microRNA miR396 // Development. - 2010. - Vol.137. - P. 103-112.

13. Liu D., Song Y., Chen Z. and Yu D. Ectopic expression of miR396 suppresses GRF target gene expression and alters leaf growth
in Arabidopsis // Physiol. Plant. - 2009.- Vol. 136. - P. 223-236.

14. Palatnik J.F., Allen E., Wu X., Schommer C., Schwab R., Carrington J.C., Weigel, D. Control of leaf morphogenesis by
microRNAs // Nature. - 2003. - Vol. 425. - P. 257-263.
Как цитировать
SAGAIDAK, A. I. et al. Связывание microRNA с mRNA генов рост-регулирующих транскрипционных факторов арабидопсиса, риса и кукурузы. microRNA-ның арабидопсис, күрiш жəне жүгерiнің өсудi реттейтiн транскрипция факторлары гендерінің mRNA-дарымен байланысуы. Вестник КазНУ. Серия биологическая, [S.l.], v. 59, n. 3/1, p. 289-291, apr. 2015. ISSN 2617-7498. Доступно на: <https://bb.kaznu.kz/index.php/biology/article/view/778>. Дата доступа: 25 jan. 2021
Раздел
Физико-химическая биология и нанотехнологии

Ключевые слова

miRNA; mRNA; miR396; растение.miRNA; mRNA; miR396; өсімдік

Наиболее читаемые статьи этого автора (авторов)

Особенность: этот модуль требует, что бы был включен хотя бы один модуль статистики/отчетов. Если ваши модули статистики возвращают больше одной метрики, то пожалуйста также выберите главную метрику на странице настроек сайта администратором и/или на страницах настройки управляющего журналом.