МикроРНК и гены, связанные с развитием ишемической болезни сердца

A. T. Ivashchenko; R. Y. Niyazova; S. A. Atambayeva; A. Y. Pyrkova; I. V. Pinsky; A. Z. Alybayeva; A. N. Akimniyazova; A. A. Mamirova

Авторы

A. T. Ivashchenko Научно-исследовательский институт проблем биологии и биотехнологии Казахского национального университета им. аль-Фараби, Республика Казахстан, г. Алматы
R. Y. Niyazova Научно-исследовательский институт проблем биологии и биотехнологии Казахского национального университета им. аль-Фараби, Республика Казахстан, г. Алматы
S. A. Atambayeva Научно-исследовательский институт проблем биологии и биотехнологии Казахского национального университета им. аль-Фараби, Республика Казахстан, г. Алматы
A. Y. Pyrkova Научно-исследовательский институт проблем биологии и биотехнологии Казахского национального университета им. аль-Фараби, Республика Казахстан, г. Алматы
I. V. Pinsky Научно-исследовательский институт проблем биологии и биотехнологии Казахского национального университета им. аль-Фараби, Республика Казахстан, г. Алматы
A. Z. Alybayeva Научно-исследовательский институт проблем биологии и биотехнологии Казахского национального университета им. аль-Фараби, Республика Казахстан, г. Алматы
A. N. Akimniyazova Научно-исследовательский институт проблем биологии и биотехнологии Казахского национального университета им. аль-Фараби, Республика Казахстан, г. Алматы
A. A. Mamirova Научно-исследовательский институт проблем биологии и биотехнологии Казахского национального университета им. аль-Фараби, Республика Казахстан, г. Алматы

Ключевые слова:

miRNA, mRNA, сайты связывания, гены-мишени, ишемическая болезнь сердца.

Аннотация

Изучены характеристики взаимодействия miRNA с mRNA генов, участвующих в развитии ишемической болезни сердца (ИБС). В mRNA генов, участвующих в развитии ИБС, для 2564 miRNA найдены 268 сайтов связывания miRNA в 5´UTR, CDS и 3´UTR. Для диагностики ИБС рекомендуются: ассоциации miR-1272 с генами ANGPTL2, C3 и IGFBP3; ассоциации miR-1285-5p с генами FGF2 и MMP2; ассоциации miR-3960 с геном DAB2IP. По шесть miRNA связываются с mRNA AS3MT, F2RL3, IL6R, MLXIPL, PPP1R3B и TGFB1. По семь miRNA связываются с mRNA LDLR и NPC1L1. С mRNA IL6R связывается девять miRNA. Экспрессия многих генов зависит от уникальных miRNA: miR-619-5р имеет 14 генов-мишеней, miR-5095 и miR-5096 имеют по 10 генов. Семейство miR-1273a,c,d,e,f,g,h имеет 38 сайтов связывания. mRNA IL10, IL18, IL6R сильно связываются с miR-619-5р, miR-5095 и miR-5096. В mRNA нескольких генов имеются сайты связывания miR-619-5р с miR-5585-3p. mRNA NOS1 содержит сайты связывания miR-619-5p, miR-5095, miR-1273g-3p, miR-574-5p и miR-466. miR-466 имеет множественные сайты в mRNA ICAM1, TNFSF4, MLXIPL и PLA2G7. miR-574-5p имеет множественные сайты в mRNA IGF1 и PPARA.

Биографии авторов

A. T. Ivashchenko, Научно-исследовательский институт проблем биологии и биотехнологии Казахского национального университета им. аль-Фараби, Республика Казахстан, г. Алматы

Иващенко Анатолий Тимофеевич, д.б.н., профессор КазНУ им.аль-Фараби, кафедра биотехнологии
R. Y. Niyazova, Научно-исследовательский институт проблем биологии и биотехнологии Казахского национального университета им. аль-Фараби, Республика Казахстан, г. Алматы

Ниязова Райгуль Есенгельдиевна, к.б.н., доцент КазНУ им.аль-Фараби, кафедра биотехнологии
S. A. Atambayeva, Научно-исследовательский институт проблем биологии и биотехнологии Казахского национального университета им. аль-Фараби, Республика Казахстан, г. Алматы

Атамбаева Шара Алпысбаевна, к.б.н., доцент КазНУ им.аль-Фараби, кафедра биотехнологии
A. Y. Pyrkova, Научно-исследовательский институт проблем биологии и биотехнологии Казахского национального университета им. аль-Фараби, Республика Казахстан, г. Алматы

Пыркова Анна Юрьевна, к.т.н., доцент КазНУ им.аль-Фараби, кафедра информатики
I. V. Pinsky, Научно-исследовательский институт проблем биологии и биотехнологии Казахского национального университета им. аль-Фараби, Республика Казахстан, г. Алматы

Пинский Илья Владимирович, магистр, стажер-исследователь НИИ проблем биологии и биотехнологии КазНУ им.аль-Фараби
A. Z. Alybayeva, Научно-исследовательский институт проблем биологии и биотехнологии Казахского национального университета им. аль-Фараби, Республика Казахстан, г. Алматы

Алыбаева Айгуль Жамятовна, стажер-исследователь НИИ проблем биологии и биотехнологии КазНУ им.аль-Фараби
A. N. Akimniyazova, Научно-исследовательский институт проблем биологии и биотехнологии Казахского национального университета им. аль-Фараби, Республика Казахстан, г. Алматы

Акимниязова Айгуль Нурлановна, стажер-исследователь НИИ проблем биологии и биотехнологии КазНУ им.аль-Фараби
A. A. Mamirova, Научно-исследовательский институт проблем биологии и биотехнологии Казахского национального университета им. аль-Фараби, Республика Казахстан, г. Алматы

Мамирова Айгерим Аманжоловна, стажер-исследователь НИИ проблем биологии и биотехнологии КазНУ им.аль-Фараби