МикроРНК и гены, связанные с инфарктом миокарда

A. T. Ivashchenko; R. Y. Niyazova; S. A. Atambayeva; A. Y. Pyrkova; I. V. Pinsky; A. Z. Alybayeva; A. N. Akimniyazova; A. A. Mamirova; E. K. Makashev

Авторы

A. T. Ivashchenko Научно-исследовательский институт проблем биологии и биотехнологии Казахского национального университета им. аль-Фараби, Республика Казахстан, г. Алматы
R. Y. Niyazova Научно-исследовательский институт проблем биологии и биотехнологии Казахского национального университета им. аль-Фараби, Республика Казахстан, г. Алматы
S. A. Atambayeva Научно-исследовательский институт проблем биологии и биотехнологии Казахского национального университета им. аль-Фараби, Республика Казахстан, г. Алматы
A. Y. Pyrkova Научно-исследовательский институт проблем биологии и биотехнологии Казахского национального университета им. аль-Фараби, Республика Казахстан, г. Алматы
I. V. Pinsky Научно-исследовательский институт проблем биологии и биотехнологии Казахского национального университета им. аль-Фараби, Республика Казахстан, г. Алматы
A. Z. Alybayeva Научно-исследовательский институт проблем биологии и биотехнологии Казахского национального университета им. аль-Фараби, Республика Казахстан, г. Алматы
A. N. Akimniyazova Научно-исследовательский институт проблем биологии и биотехнологии Казахского национального университета им. аль-Фараби, Республика Казахстан, г. Алматы
A. A. Mamirova Научно-исследовательский институт проблем биологии и биотехнологии Казахского национального университета им. аль-Фараби, Республика Казахстан, г. Алматы
E. K. Makashev Институт физиологии человека и животных, Республика Казахстан, г. Алматы

Ключевые слова:

miRNA, mRNA, сайты связывания, гены-мишени, инфаркт миокарда.

Аннотация

При анализе взаимодействия 2564 miRNA с mRNA 185 генов, участвующих в развитии инфаркта миокарда человека, найдены 304 сайта связывания miRNA в 5'-UTR, CDS и 3'-UTR mRNA этих генов. Для 54 miRNA, участвующих в развитии инфаркта миокарда человека, из mRNA 17510 генов выявлено 17 генов-мишеней. Выявлены ассоциации miRNA и генов мишеней, характеристики которых позволяют использовать их в качестве диагностических маркеров при инфаркте миокарда. Для диагностики предпочтительно использовать ассоциации одной miRNA с mRNA нескольких генов, либо нескольких miRNA с mRNA одного гена. Рекомендованы ассоциации miRNA и mRNA генов мишеней с высокой свободной энергией взаимодействия miRNA с mRNA: miR-3960, miR-466, miR-574-5p вместе с парами их генов мишеней - PDE4D и SCAP, GSN и TNFSF4, CD40LG и OLR1, соответственно. Для диагностики предложены miRNA и mRNA генов мишеней с высокой величиной свободной энергии взаимодействия в сайтах связывания: miR-1273d, miR-4758-5p и miR-4763-5p связывающиеся с mRNA генов PPIA, NFKB1 и SH2B1, соответственно. miR-1226-5p с mRNA гена ALDH2, miR-1183 с mRNA гена THBS1, и miR-6089-5p с mRNA генов ADAM8, IL6R и TFAM.