microRNA и гены, связанные с метаболическим синдромом

R. Y. Niyazova; S. A. Atambayeva; I. V. Pinsky; A. N. Akimniyazova; A. A. Mamirova; A. Y. Pyrkova; A. T. Ivashchenko; S. B. Labeit

Авторлар

R. Y. Niyazova әл-Фараби атындағы Қазақ ұлттық университеттің Биология және биотехнология проблемаларының ғылыми-зерттеу институты, Қазақстан Республикасы, Алматы қ.
S. A. Atambayeva әл-Фараби атындағы Қазақ ұлттық университеттің Биология және биотехнология проблемаларының ғылыми-зерттеу институты, Қазақстан Республикасы, Алматы қ.
I. V. Pinsky әл-Фараби атындағы Қазақ ұлттық университеттің Биология және биотехнология проблемаларының ғылыми-зерттеу институты, Қазақстан Республикасы, Алматы қ.
A. N. Akimniyazova әл-Фараби атындағы Қазақ ұлттық университеттің Биология және биотехнология проблемаларының ғылыми-зерттеу институты, Қазақстан Республикасы, Алматы қ.
A. A. Mamirova әл-Фараби атындағы Қазақ ұлттық университеттің Биология және биотехнология проблемаларының ғылыми-зерттеу институты, Қазақстан Республикасы, Алматы қ.
A. Y. Pyrkova әл-Фараби атындағы Қазақ ұлттық университеттің Биология және биотехнология проблемаларының ғылыми-зерттеу институты, Қазақстан Республикасы, Алматы қ.
A. T. Ivashchenko әл-Фараби атындағы Қазақ ұлттық университеттің Биология және биотехнология проблемаларының ғылыми-зерттеу институты, Қазақстан Республикасы, Алматы қ.
S. B. Labeit Гейдельберг Университетінің Медициналық орталығы, Германия Федеративтік Республикасы, г. Мангейм

Кілт сөздер:

miRNA, mRNA, байланысу сайттары, нысана гендер, метаболиттік синдром.

Аңдатпа

Метаболиттік синдромның дамуына қатысатын гендер мен miRNAдың мәліметтер базасы құрастырылған. 118 гендердің mRNAмен 94 miRNA байланысады, ΔG/ΔG_m90% астам. 48 miRNA үшін байланысу сайттар CDS, 19 miRNA үшін 5'UTR, 43 miRNA үшін 3'UTRде орналасқан. Кейбір miRNA үшін нысана гендердің mRNAда полисайттар бар екені анықталған: miR-466 – төрт сайт CD36 геннің mRNAда, тоғыз сайт JAK2 геннің mRNAда, miR-619-5p – үш сайт LDLR геннің mRNAда, miR-3960 – үш сайт CEBPA геннің mRNAда. Кейбір miRNA үшін метаболиттік синдромның дамуына қатысатын бірнеше нысана гендер анықталған. miR-3960 үшін төрт нысана гендер, miR-466 – алты, miR-1273f, miR-5095 - жеті, miR-1285-5p – сегіз, miR-5096 – тоғыз, miR-5585-3p – он, miR-1273g-3p, miR-619-5p – 13 нысана гендер бар. Метаболиттік синдромның дамуына қатысатын 42 miRNA қатарынан, 33 miRNAдың экспрессиясы жоғарлайды, тоғыз miRNAдың экспрессиясы томендейді. Кейбір miRNA үшін бірнеше нысана гендері бар: miR-185-3p, miR-378g - 11 нысана гендер, miR-197-3p, miR-378d – он ген, miR-150-3p, miR-378a-3p, miR-378i – тоғыз ген, miR-145-3p – сегіз ген, miR-197-5p, miR-378b - жеті нысана гендер.

Автор өмірбаяндары

R. Y. Niyazova, әл-Фараби атындағы Қазақ ұлттық университеттің Биология және биотехнология проблемаларының ғылыми-зерттеу институты, Қазақстан Республикасы, Алматы қ.

Ниязова Райгуль Есенгельдиевна, к.б.н., доцент КазНУ им.аль-Фараби, кафедра биотехнологии
S. A. Atambayeva, әл-Фараби атындағы Қазақ ұлттық университеттің Биология және биотехнология проблемаларының ғылыми-зерттеу институты, Қазақстан Республикасы, Алматы қ.

Атамбаева Шара Алпысбаевна, к.б.н., доцент КазНУ им.аль-Фараби, кафедра биотехнологии
I. V. Pinsky, әл-Фараби атындағы Қазақ ұлттық университеттің Биология және биотехнология проблемаларының ғылыми-зерттеу институты, Қазақстан Республикасы, Алматы қ.

Пинский Илья Владимирович, магистр, стажер-исследователь НИИ проблем биологии и биотехнологии КазНУ им.аль-Фараби
A. N. Akimniyazova, әл-Фараби атындағы Қазақ ұлттық университеттің Биология және биотехнология проблемаларының ғылыми-зерттеу институты, Қазақстан Республикасы, Алматы қ.

Акимниязова Айгуль Нурлановна, стажер-исследователь НИИ проблем биологии и биотехнологии КазНУ им.аль-Фараби
A. A. Mamirova, әл-Фараби атындағы Қазақ ұлттық университеттің Биология және биотехнология проблемаларының ғылыми-зерттеу институты, Қазақстан Республикасы, Алматы қ.

Мамирова Айгерим Аманжоловна, стажер-исследователь НИИ проблем биологии и биотехнологии КазНУ им.аль-Фараби
A. Y. Pyrkova, әл-Фараби атындағы Қазақ ұлттық университеттің Биология және биотехнология проблемаларының ғылыми-зерттеу институты, Қазақстан Республикасы, Алматы қ.

Пыркова Анна Юрьевна, к.т.н., доцент КазНУ им.аль-Фараби, кафедра информатики
A. T. Ivashchenko, әл-Фараби атындағы Қазақ ұлттық университеттің Биология және биотехнология проблемаларының ғылыми-зерттеу институты, Қазақстан Республикасы, Алматы қ.

Иващенко Анатолий Тимофеевич, д.б.н., профессор КазНУ им.аль-Фараби, кафедра биотехнологии