Характеристики связывания bta-miRNA с mRNA генов транскрипционных факторов семейства MYB Bos taurus. Вta-miRNA-ның MYB Bos taurus жиынтығы транскрипциондық факторлар гендерінің mRNA-сымен байланысуының сипаттамасы

A. T. Ivashchenko; A. Zh. Аlybayeva; R. E. Niyazova

Авторы

A. T. Ivashchenko Национальная нанотехнологическая лаборатория КазНУ имени аль-Фараби
A. Zh. Аlybayeva Национальная нанотехнологическая лаборатория КазНУ имени аль-Фараби
R. E. Niyazova Национальная нанотехнологическая лаборатория КазНУ имени аль-Фараби,

Ключевые слова:

mRNA, miRNA, гены-мишени, транскрипционные факторы. mRNA, нысана гендер, транскрипциондық факторлар

Аннотация

Изучены взаимодействия 749 miRNA генома Bos taurus с mRNA20 генов транскрипционных факторов семейства MYB. Установлены сайты связывания 58 miRNA с mRNA восьми генов семейства MYB. В mRNA каждого из генов выявлено от трех сайтов связывания для гена MYBL1 до 21 сайта связывания для гена NCOR1. MiR-1260b имела сайты связывания в мRNA генов MIER1, NCOR1, RCOR1. Девять miRNA имели сайты связывания в mRNA двух генов. Величина ΔG/ΔGm, характеризующая степень сродства miRNA к mRNA, изменялась от 85 до 90%. Обсуждается роль bta-miRNA в регуляции экспрессии генов-мишеней транскрипционных факторов семейства MYB. Bos taurus геномының 749 miRNA-сының MYB Bos taurus жиынтығы транскрипциондық факторларының 20 генінің mRNA-сымен байланысуы зерттелді. 58 miRNA-ның сегіз геннің mRNA-мен байланысу сайттары анықталды. Әрбір геннің miRNA-сында MYBL1 гені үшін үш байланысу сайты, NCOR1 гені үшін 21 байла- нысу сайты табылды. Тоғыз miRNA екі геннің mRNA-сында байланысу сайттары анықталды. miRNA-ның mRNA-мен туыстық дәрежесін анықтайтын ΔG/ΔGm, мәні 85%-дан 90%-ға дейін өзгерді. Bta-miRNA-ның MYB жиынтығы транскрипционды факторлар нысана-гендерінің экспрессиясын реттеудегі ролі талқылануда.