СВЯЗЫВАНИЕ МЕЖГЕННЫХ microRNA ЧЕЛОВЕКА С САЙТАМИ mRNA ГЕНОВ, УЧАСТВУЮЩИХ В РАЗВИТИИ РАКА ТОЛСТОЙ КИШКИ

Анотація

Выявлены сайты связывания 784 межгенных miRNA с 5'UTR, CDS и 3'UTR mRNA 54 генов, которые участвуют в развитии рака толстой кишки человека. Установлено существенное отличие 5'UTR, CDS и 3'UTR по числу сайтов связывания с межгенными miRNA. Средняя плотность сайтов связывания в 5'UTR mRNA 40 генов равнялась 33,1 s/l и была в 6,5, 4,7 и 3,8 раза больше, чем в 3'UTR, CDS и всей mRNA соответственно. Многие межгенные miRNA, связываются в некоторых mRNA с несколькими сайтами. Некоторые mRNA в 5'UTR имеют участки с высокой плотностью связывания miRNA. Доля длины 5'UTR, CDS и 3'UTR от средней длины mRNA 40 генов-мишеней для межгенных miRNA в среднем составляла 4,4%, 59,9%, 29,4%, а доля сайтов взаимодействия межгенных miRNA с 5'UTR, CDS и 3'UTR составляла 22,4, 49,2 и 28,4% соответственно. Результаты проведенных исследований показывают, что miRNA могут осуществлять регуляцию экспрессии генов как посредством связывания в 3'UTR, так и действуя на 5'UTR и CDS. Адамның тоқ ішек ісігінің дамуына қатысатын 54 геннің mRNA-не 784 генаралық miRNA байланысу сайттары анықталды. Генаралық miRNA 5'UTR, CDS жəне 3'UTR-мен байланысатын сайттардың саны бойынша елеулі өзгешеліктер тіркелді. 40 геннің mRNA 5'UTR-дегі сайттардың орташа тығыздығы 33,1 s/l болды жəне 3'UTR, CDS-тан 6,5, 4,7 жəне 3,8 есе артық болды. Көптеген генаралық miRNA mRNA-мен бірнеше сайтта байланысады. Кейбір mRNA 5'UTR-де miRNA-ны жоғары тығыздықта байланыстыратын аудандар бар. Генаралық miRNA нысаны болып табылатын 40 геннің mRNA орташа ұзындығынан 5'UTR, CDS жəне 3'UTR ұзындықтарының үлесі 4,4%, 59,9%, 29,4% құрайды, ал 5'UTR, CDS жəне 3'UTR-мен байланысатын сайттардың үлесі сəйкесінше 22,4, 49,2 жəне 28,4% құрайды. Жүргізілген зерттеулердің нəтижесі miRNA ген экспрессиясын 3'UTR байланысу арқылы жəне 5'UTR жəне CDS əсер ету арқылы реттей алатыны көрсетілді.