СВОЙСТВА ИНТРОННЫХ miRNA ЧЕЛОВЕКА И ОСОБЕННОСТИ ИХ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ С mRNA
Ключевые слова:
кодирующиe интронные miRNA, интронды miRNA кодтайтын 51 ген,Аннотация
Установлены сайты взаимодействия 686 интронных miRNA miRNA с mRNA 51 генов кодирующих интронные miRNA. Выявлены особенности взаимодействия изученных miRNA с 5'UTR, CDS и 3'UTR mRNA каждого гена. Установлена значительная гетерогенность функциональных участков mRNA по плотности расположения этих сайтов и по числу сайтов связывания с miRNA. Выявлены miRNA отличающиеся высокой селективностью к mRNA определенных генов. Бұл жұмыста 686 интронды miRNA-дың интронды miRNA кодтайтын 51 геннің mRNA-мен байланысусайттары анықталды. Зерттелген miRNA-дың əрбір геннің mRNA-ның 5'UTR, CDS жəне 3'UTR-мен байланысу ерекшеліктері зерттелді. RNA функциональді бөліктерінің miRNA-мен байланыстыру сайттарының саны бойынша жəне бұл сайттардың орналасу тығыздығына байланысты гетерогенділік анықталды. Кейбір miRNA гендердің mRNA-на сұрыптаушылықпен ерекшеленеді.Библиографические ссылки
1 Vella M.C., Slack F.C. C. elegans microRNAs // The C. elegans Research Community. - 2005. - V. 6. - № 2. -P. 11-20
2 Rodriguez A., et al. Identification of mammalian microRNA host genes and transcription units // Genome Res.- 2004. - V. 14. - P. 1902-191
3 Lutter D., Marr C., Krumsiek J., Lang E.W., Theis F.J. Intronic microRNAs support their host genes bymediating synergistic and antagonistic regulatory effects // BMC Genomics. - 2010. - V. 11:224. - doi:10.1186/1471-2164-11-224.
4 Ying S.-Y., Lin S.-L. Current Perspectives In Intronic microRNAs (miRNAs) // Journal of Biomedical Science. -2006. - V.13, № 2. - С. 23-30.
5 Lee E. J., Gusev Y., Jiang J. Expression profiling identifies microRNA signature in pancreatic cancer. // Int J
Cancer. - 2006. - V. 45, № 3. - P. 36-40.
6 Bloomston M., Frankel W.L., Petrocca F. Profils d’expression du microARN pour différencierl’adénocarcinome pancréatique d’un pancréas normal et d’une pancréatite chronique // JAMA. - 2007. - V. 297. - №
17. - P. 190.
7 Iorio M.V., Ferracin M., Liu C.G. MicroRNA gene expression deregulation in // Cancer Res. - 2005. - V. 65. -P. 7065-7070.
8 Ryan B.M., Robles A.I., Harris C.C. Genetic variation in microRNA networks: the implications for cancerresearch // Nat. Rev. Cancer. - 2010. - V. 10 (6). - P. 389-402.
9 Emma V. B., et al. microRNA evaluation of unknown primary lesions in the head and neck // MolecularCancer. - 2009. - V. 8. - № 127. - P. 1-7.
2 Rodriguez A., et al. Identification of mammalian microRNA host genes and transcription units // Genome Res.- 2004. - V. 14. - P. 1902-191
3 Lutter D., Marr C., Krumsiek J., Lang E.W., Theis F.J. Intronic microRNAs support their host genes bymediating synergistic and antagonistic regulatory effects // BMC Genomics. - 2010. - V. 11:224. - doi:10.1186/1471-2164-11-224.
4 Ying S.-Y., Lin S.-L. Current Perspectives In Intronic microRNAs (miRNAs) // Journal of Biomedical Science. -2006. - V.13, № 2. - С. 23-30.
5 Lee E. J., Gusev Y., Jiang J. Expression profiling identifies microRNA signature in pancreatic cancer. // Int J
Cancer. - 2006. - V. 45, № 3. - P. 36-40.
6 Bloomston M., Frankel W.L., Petrocca F. Profils d’expression du microARN pour différencierl’adénocarcinome pancréatique d’un pancréas normal et d’une pancréatite chronique // JAMA. - 2007. - V. 297. - №
17. - P. 190.
7 Iorio M.V., Ferracin M., Liu C.G. MicroRNA gene expression deregulation in // Cancer Res. - 2005. - V. 65. -P. 7065-7070.
8 Ryan B.M., Robles A.I., Harris C.C. Genetic variation in microRNA networks: the implications for cancerresearch // Nat. Rev. Cancer. - 2010. - V. 10 (6). - P. 389-402.
9 Emma V. B., et al. microRNA evaluation of unknown primary lesions in the head and neck // MolecularCancer. - 2009. - V. 8. - № 127. - P. 1-7.
Загрузки
Выпуск
Раздел
БИОТЕХНОЛОГИЯ, БИОХИМИЯ И ФИЗИОЛОГИЯ РАСТЕНИЙ
