Формирование коллекции пшеницы для поиска новых аллелей генома. Геномның жаңа аллельдерін табу үшін бидайдың коллекциясын жасау
46 57
Ключевые слова:
пшеница, полиморфизм, коллекция, секвенирование, ДНК, ген, молекулярно-генетичексие маркеры, изоферменты, бидай, жиынтық, секвендеу, ДНҚ, молекулярлы-генетикалық маркер, изо- ферменттерАннотация
Проблема сохранения биологического разнообразия на уровне генов, является весьма актуальной. Одной из первостепенных задач является выбор подходов, технологий и критериев оценки генетического разнообразия. К приоритетным направлениям науки относятся развитие технологий анализа геномов растений. Одним из важных аспектов генетики и практической селекции растений Является детальная характеристика используемого материала. Для решения этой задачи внедряются новые технологии, которые базируются на анализеполиморфизма ДНК. Наиболее важным моментом в подобного рода исследованиях является формирование репрезентативных коллекций, содержащих все аллельные варианты и комбинации генов. Формирование коллекции пшеницы, ляющееся целью проводимых исследований, было проведено для выявления генетических форм исследуемого вида. Гендер деңгейінде биологиялық әртүрлілікті сақтау мәселесі өзекті болып табылады. Негізгі мәселелердің бірі генетикалық түрлілікті бағалау үшін технологиялар мен крителийлерді таңдау болып табылады. Ғылымның басты бағыттарына өсімдік геномын талдау технологияларын дамыту жатады. Өсімдіктер генетикасы мен практикалық селекцияның негізгі аспектілерінің бірі пайдалынатын материалды егжей-тегжейлі сипаттау болып табылады. Бұл мәселені шешу үшін ДНҚ полиморфизм талдауына негізделген жаңа технологиялар енгізілуде. Осындай зерттеулер кезіндегі негізгі мәселе гендердің барлық комбинациялары мен аллельді нұсқалары бар репрезентативті коллекция жасау болып табылады. Зерттеу мақсаты болып табылатын бидай жиынтығын құрастыру зерттелетін түрдің генетикалық формаларын анықтау үшін жасалған болатын.Библиографические ссылки
1 Митрофанова О.П. Генетические ресурсы пшеницы в России: состояние и предселекционное изучение // Вавиловский журнал генетики и селекции. – 2012. – Т. 16, № 1. – С. 10 – 20.
2 Paux E., Sourdille P., Salse J., Saintenac C., Choulet F., Leroy P., Korol A., Michalak M., Kianian S., Spielmeyer W., Lagudah E.,Somers D., Kilian A., Alaux M., Vautrin S., Berges H., Eversole K., Appels R., Safar J. A physical map of the 1-gigabase bread wheat chromosome 3B // Science. – 2008. – Vol. 322. – P. 101 – 104.
3 Rabinowicz P.D., Citek R., Budiman M.A., Nunberg A., Bedell J.A., Lakey N., O’Shaughnessy A.L., Nascimento L.U., Mc-Combie W.R., Martienssen R.A. Differential methylation of genes and repeats in land plants // Genome Res. – 2005. – Vol. 15. – P.1431– 1440.
4 Berkman P.J., Skarshewski A., Lorenc M.T., Lai K., Duran C., Ling E.Y..S, Stiller J., Smits L., Imelfort M., Manoli S., McKenzie M., Kubalakova M., Simkova H., Batley J., Fleury D., Dolezel J., Edwards D. Sequencing and assembly of low copy and genic regions of isolated Triticum aestivum chromosome arm 7DS// Plant Biotech J. – 2011. – Vol. 9. – P. 768 – 775.
5 Wanjugi H., Coleman-Derr D., Huo N.X., Kianian S.F., Luo M.C., Wu J.J., Anderson O, Gu Y.Q. Rapid development of PCRbased genome-specific repetitive DNA junction markers in wheat // Genome. – 2009. – Vol. 52. – P.576 – 587.
6 http://urgi.versailles.inra.fr/gb2/gbrowse/wheat_phys_pub/
7 Гончаров П.Л. Генофонд сельскохозяйственных культур для селекции устойчивых сортов. – Новосибирск, 1999.– С. 3–6.
8 Scanolalios J. G., Chao S.E. Melville J. C. Biochemical characterization of the major amylase form coded by the Amy -1 gene in maisze // Nature biotechnology. – 1978. – Vol. 69. – P.149 – 154.
2 Paux E., Sourdille P., Salse J., Saintenac C., Choulet F., Leroy P., Korol A., Michalak M., Kianian S., Spielmeyer W., Lagudah E.,Somers D., Kilian A., Alaux M., Vautrin S., Berges H., Eversole K., Appels R., Safar J. A physical map of the 1-gigabase bread wheat chromosome 3B // Science. – 2008. – Vol. 322. – P. 101 – 104.
3 Rabinowicz P.D., Citek R., Budiman M.A., Nunberg A., Bedell J.A., Lakey N., O’Shaughnessy A.L., Nascimento L.U., Mc-Combie W.R., Martienssen R.A. Differential methylation of genes and repeats in land plants // Genome Res. – 2005. – Vol. 15. – P.1431– 1440.
4 Berkman P.J., Skarshewski A., Lorenc M.T., Lai K., Duran C., Ling E.Y..S, Stiller J., Smits L., Imelfort M., Manoli S., McKenzie M., Kubalakova M., Simkova H., Batley J., Fleury D., Dolezel J., Edwards D. Sequencing and assembly of low copy and genic regions of isolated Triticum aestivum chromosome arm 7DS// Plant Biotech J. – 2011. – Vol. 9. – P. 768 – 775.
5 Wanjugi H., Coleman-Derr D., Huo N.X., Kianian S.F., Luo M.C., Wu J.J., Anderson O, Gu Y.Q. Rapid development of PCRbased genome-specific repetitive DNA junction markers in wheat // Genome. – 2009. – Vol. 52. – P.576 – 587.
6 http://urgi.versailles.inra.fr/gb2/gbrowse/wheat_phys_pub/
7 Гончаров П.Л. Генофонд сельскохозяйственных культур для селекции устойчивых сортов. – Новосибирск, 1999.– С. 3–6.
8 Scanolalios J. G., Chao S.E. Melville J. C. Biochemical characterization of the major amylase form coded by the Amy -1 gene in maisze // Nature biotechnology. – 1978. – Vol. 69. – P.149 – 154.
Загрузки
Как цитировать
Khapilina, O. N., Kairova, M. Z., & Kalendar, R. N. (2015). Формирование коллекции пшеницы для поиска новых аллелей генома. Геномның жаңа аллельдерін табу үшін бидайдың коллекциясын жасау. Вестник КазНУ. Серия биологическая, 60(1), 56–59. извлечено от https://bb.kaznu.kz/index.php/biology/article/view/56
Выпуск
Раздел
Биоинформатика, геномика и протеомика. Физико-химическая биология
