Interaction of genes and microRNA related to the development of prostate cancer

M. Ormanova; R. Niyazova; Sh. Atambaeva; A. Ivashchenko

doi:10.26577/eb-2018-1-1315

Авторы

M. Ormanova Казахский национальный университет имени аль-Фараби, Казахстан, г. Алматы
R. Niyazova Научно-исследовательский институт проблем биологии и биотехнологии Казахского национального университета имени аль-Фараби, Казахстан, г. Алматы
Sh. Atambaeva Научно-исследовательский институт проблем биологии и биотехнологии Казахского национального университета имени аль-Фараби, Казахстан, г. Алматы
A. Ivashchenko Научно-исследовательский институт проблем биологии и биотехнологии Казахского национального университета имени аль-Фараби, Казахстан, г. Алматы

DOI:

https://doi.org/10.26577/eb-2018-1-1315

Ключевые слова:

рак простаты, ген, microRNA, mRNA, диагностика.

Аннотация

Проведен поиск генов-кандидатов и микроРНК, связанных с развитием рака простаты. Создана база данных по генам, включающая 67 генов, связанных с развитием рака простаты. Проанализированы в сравнительном аспекте функции этих генов. Некоторые гены являются специфическими к раку простаты, многие являются участниками разных онкологических заболеваний. Экспрессия генов ASAH1, AURKA, BMI1, EPHB2, GBX2 приводит к стимуляции злокачественного роста клеток рака предстательной железы и потенциально могут служить терапевтическими мишенями данного онкологического заболевания. Создана база данных по микроРНК, связанных с развитием рака простаты. Определены особенности связывания генов, участвующих в развитии рака простаты с miRNA, принимающих участие в развитии рака. Согласно проведенным расчетам, mRNA 67 генов, участвующих в развитии рака простаты, связываются с девятью miRNA с высокой энергией связывания. Сайты располагаются в CDS, 5'UTR и 3'UTR. Некоторые miRNA имеют несколько генов мишеней, участвующих в развитии рака простаты. Для miR-619-5p, miR-574-3p, miR-3960, miR-1285-3p имеются множественные сайты с ΔG/ΔG_m более 90%. miR-619-5p имеет сайты с наибольшей энергией связывания 121 kJ/m с ΔG/ΔG_m равным 100% в mRNA гена XIAP. C ΔG/ΔG_m равным 98% возможно связывание miR-619-5p с mRNA генов AURKA, BRCA1, FMN1, IL10, MYO6, UHRF1BP1, ответственных за развитие рака простаты.