Изучение генетического разнообразия образцов картофеля микросателлитными маркерами. Микросателлитті маркерлермен картоп үлгілерінің генетикалық әр түрлілігін зерттеу
Ключевые слова:
картофель, сорт, ДНК, SSR-маркер, локус, аллель, картоп, ДНҚ,Аннотация
В работе использовали следующие методы исследований: выделение и очистка ДНК из образцов картофеля, определение количества и чистоты выделенной ДНК, амплификация ДНК с SSR-праймерами, электрофорез в полиакриламидном геле, построение дендрограммы с использованием алгоритма UPGMA и компьютерной программы TREECON. В исследованиях использовали 7 пар микросателлитных праймеров для оценки полиморфизма 48 сортов казахстанской и зарубежной селекции, которые в совокупности генерировали 41 амплификационных фрагментов размером от 111 до 244 п.н. Уровень полиморфизма изученных локусов оказался достаточно высоким и составил 97,6%. На основе полученных SSR-аллелей методом кластерного анализа были определены генетические расстояния между 48 генотипами картофеля и построена дендрограмма. Зерттеу жұмысында келесі әдістер қолданылды: картоптың селекциондық клоны мен сорттарынан ДНҚ-ны бөліп алу және тазалау, бөлініп алынған ДНҚ-ның тазалығы мен санын анықтау, ДНҚ-ны SSR праймерімен амплификациялау, полиакриламид гелінде электрофорез жүргізу, TREECON компьютерлік бағдарламасы мен UPGMA алгоритмін қолданып дендрограмма құрастыру. Зерттеу жұмысында шетелдік және қазақстандық селекциясының 48 сортының полиморфизміне баға беру үшін 7 жұп микросателлитті праймер қолданылған. Олар өз кезегінде өлшемі 111 - 244 ж.н. болатын 41 амплификациялық фрагмент берді. Зерттелген локустардың полиморфизм деңгейі жоғары болды және ол 97,6 %-ды құрады. SSR аллельдердің негізінде кластерлік талдау әдісімен картоптың 48 генотиптер арасындағы генетикалық алшақтық анықталды және дендрограмма құрылдыБиблиографические ссылки
1 Yumiko F., Hiroyuki F., Hiroshi Y. Identification of wheat cultivars using EST-SSR markers // Breeding Science. - 2009. - Vol. 59. - P.159-167.
2 Ghislain M., Nunez J., Rosario Herrera M., Pignataro J., Guzman F., Bonierbale M., Spooner D.M. Robust and highly informative microsatellite-based genetic identity kit for potato //Molecular Breeding. - 2009. - Vol. 23. - P. 377-388.
3 Edwards S.K., Johnstone C., Thompson C. Simple and rapid method for the preparation of plant genomic DNA for PCR analysis // Nucleic Acids Res. – 1991. - Vol. 19. - № 6. - P.1349.
2 Ghislain M., Nunez J., Rosario Herrera M., Pignataro J., Guzman F., Bonierbale M., Spooner D.M. Robust and highly informative microsatellite-based genetic identity kit for potato //Molecular Breeding. - 2009. - Vol. 23. - P. 377-388.
3 Edwards S.K., Johnstone C., Thompson C. Simple and rapid method for the preparation of plant genomic DNA for PCR analysis // Nucleic Acids Res. – 1991. - Vol. 19. - № 6. - P.1349.
Загрузки
Выпуск
Раздел
БИОТЕХНОЛОГИЯ
