ҰЙҚЫ БЕЗІНІҢ ҚАТЕРЛІ ІСІГІНДЕГІ ZNF281 ГЕНІНІҢ АМПЛИФИКАЦИЯСЫ ЖӘНЕ ЭКСПРЕССИЯСЫНЫҢ ЖОҒАРЫЛАУЫ ТЕРІС БОЛЖАММЕН БАЙЛАНЫСТЫ
DOI:
https://doi.org/10.26577/eb.2022.v93.i4.08Кілттік сөздер:
Polycomb, ZNF281, онкология, ұйқы безінің қатерлі ісігі.Аннотация
Көпклеткалы организмдердің дамуы мен дұрыс дифференцияциялануы үшін түрлі клеткалардағы ген экспрессиясының нақты паттернін анықтау қажет. Транкрипцияның нәтижелі деңгейі ДНҚ нуклеотидтерінің генетикалық тізбегімен, эпигенетикалық факторлармен және модификациялаушы хроматнмен анықталады. Polycomb (PcG) тобының эпигенетикалық репрессорлары - ген транскрипциясын репрессиялайтын және көп жасушалы организмдердегі ген экспрессиясының дұрыс үлгісін сақтайтын реттеуші белоктар. PcG белоктары екі негізгі кешенді құрайды: сәйкесінше убиквитинлигазалы және гистонметилтрансферазалы ферментативті белсенділігі бар Polycomb Repressive Complex 1 (PRC 1) және Polycomb Repressive Complex 2 (PRC 2). Сүтқоректілерде Polycomb белоктарын тартуды (рекруттауды) түсіндіру үшін бірнеше механизмдер ұсынылды, олардың бірі ДНҚ-ны байланыстыратын арнайы факторлармен өзара әрекеттесуді қамтиды. Қатерлі ісіктегі негізгі PcG гендерінің реттелуінің бұзылуы жақсы құжатталғанымен, онкологиядағы PcG ДНҚ байланыстырушы серіктестерінің рөлі түсініксіз болып қалады.
Осы зерттеуде біз Polycomb-пен байланысты ДНҚ-байланыстыратын белоктардың клиникалық корреляциясын бағалау үшін клиникалық ісік үлгілерінің (cBioPortal, TNMplot, KMplot) геномдық және транскриптомдық дерекқорларын талдадық. Біз ZNF281 генінің амплификациясы мен экспрессиясының жоғарылауы ұйқы безінің қатерлі ісігінде жиі кездесетінін және жалпы өмір сүрудің теріс болжамымен байланысты екенін анықтадық.
Библиографиялық сілтемелер
Kuroda MI, Kang H, De S, Kassis JA. Dynamic Competition of Polycomb and Trithorax in Transcriptional Programming. Annu Rev Biochem. 2020. 89:235-253. doi: 10.1146/annurev-biochem-120219-103641.
Schuettengruber B, Bourbon HM, Di Croce L, Cavalli G. Genome Regulation by Polycomb and Trithorax: 70 Years and Counting. Cell. 2017. 171(1):34-57. doi: 10.1016/j.cell.2017.08.002.
Di Croce L, Helin K. Transcriptional regulation by Polycomb group proteins. Nat Struct Mol Biol. 2013. 20(10):1147-55. doi: 10.1038/nsmb.2669.
Chetverina D.A., Lomaev D.V., Georgiev P.G., Erokhin M.M. Genetic Impairments of PRC2 Activity in Oncology: Problems and Prospects. Russian Journal of Genetics. 2021. 57(3), 258-272.
Parreno V, Martinez AM, Cavalli G. Mechanisms of Polycomb group protein function in cancer. Cell Res. 2022. 32(3):231-253. doi: 10.1038/s41422-021-00606-6.
Erokhin M, Chetverina O, Győrffy B, Tatarskiy VV, Mogila V, Shtil AA, Roninson IB, Moreaux J, Georgiev P, Cavalli G, Chetverina D. Clinical Correlations of Polycomb Repressive Complex 2 in Different Tumor Types. Cancers (Basel). 2021. 13(13):3155. doi: 10.3390/cancers13133155.
Chetverina DA, Lomaev DV, Erokhin MM. Polycomb and Trithorax Group Proteins: The Long Road from Mutations in Drosophila to Use in Medicine. Acta Naturae. 2020. 12(4):66-85. doi: 10.32607/actanaturae.11090.
Straining R, Eighmy W. Tazemetostat: EZH2 Inhibitor. J Adv Pract Oncol. 2022 13(2):158-163. doi: 10.6004/jadpro. 2022. 13.2.7.
Hoy SM. Tazemetostat: First Approval. Drugs. 2020 80(5):513-521. doi: 10.1007/s40265-020-01288-x.
Kassis JA, Brown JL. Polycomb group response elements in Drosophila and vertebrates. Adv Genet. 2013. 81:83-118. doi: 10.1016/B978-0-12-407677-8.00003-8.
Chetverina DA, Elizar’ev PV, Lomaev DV, Georgiev PG, Erokhin MM. [Control of the gene activity by polycomb and trithorax group proteins in Drosophila]. Genetika. 2017. 53(2):133-54. Russian.
Erokhin M, Georgiev P, Chetverina D. Drosophila DNA-Binding Proteins in Polycomb Repression. Epigenomes. 2018. 2(1):1. doi: 10.3390/epigenomes2010001.
Oughtred R, Rust J, Chang C, Breitkreutz BJ, Stark C, Willems A, Boucher L, Leung G, Kolas N, Zhang F, et al. The BioGRID database: A comprehensive biomedical resource of curated protein, genetic, and chemical interactions. Protein Sci. 2021. 30(1):187-200. doi: 10.1002/pro.3978.
Bartha Á, Győrffy B. TNMplot.com: A Web Tool for the Comparison of Gene Expression in Normal, Tumor and Metastatic Tissues. Int J Mol Sci. 2021. 22(5):2622. doi: 10.3390/ijms22052622.
Nagy Á, Munkácsy G, Győrffy B. Pancancer survival analysis of cancer hallmark genes. Sci Rep. 2021. 11(1):6047. doi: 10.1038/s41598-021-84787-5.
Cerami E, Gao J, Dogrusoz U, Gross BE, Sumer SO, Aksoy BA, Jacobsen A, Byrne CJ, Heuer ML, Larsson E, et al. The cBio cancer genomics portal: an open platform for exploring multidimensional cancer genomics data. Cancer Discov. 2012. 2(5):401-4. doi: 10.1158/2159-8290.CD-12-0095.
Fedotova AA, Bonchuk AN, Mogila VA, Georgiev PG. C2H2 Zinc Finger Proteins: The Largest but Poorly Explored Family of Higher Eukaryotic Transcription Factors. Acta Naturae. 2017. 9(2):47-58.
Itoh Y, Takada Y, Yamashita Y, Suzuki T. Recent progress on small molecules targeting epigenetic complexes. Curr Opin Chem Biol. 2022. 67:102130. doi: 10.1016/j.cbpa.2022.102130.
Eich ML, Athar M, Ferguson JE 3rd, Varambally S. EZH2-Targeted Therapies in Cancer: Hype or a Reality. Cancer Res. 2020. 80(24):5449-5458. doi: 10.1158/0008-5472.CAN-20-2147.
Wassef M, Rodilla V, Teissandier A, Zeitouni B, Gruel N, Sadacca B, Irondelle M, Charruel M, Ducos B, Michaud A, et al. Impaired PRC2 activity promotes transcriptional instability and favors breast tumorigenesis. Genes Dev. 2015. 29(24):2547-62. doi: 10.1101/gad.269522.115.
Veneti Z, Gkouskou KK, Eliopoulos AG. Polycomb Repressor Complex 2 in Genomic Instability and Cancer. Int J Mol Sci. 2017. 18(8):1657. doi: 10.3390/ijms18081657.
Kim J. Cell Dissemination in Pancreatic Cancer. Cells. 2022. 11(22):3683. doi: 10.3390/cells11223683.
Ilic M, Ilic I. Epidemiology of pancreatic cancer. World J Gastroenterol. 2016. 22(44):9694-9705. doi: 10.3748/wjg.v22.i44.9694.
Kamisawa T, Wood LD, Itoi T, Takaori K. Pancreatic cancer. Lancet. 2016. 388(10039):73-85. doi: 10.1016/S0140-6736(16)00141-0.
