Identification of psikhrofilny petroleumoxidizing microorganisms on the basis of direct nucleotide sequence 16 S RNA identification

Authors

  • E. Zh. Khassenova РГП «Национальный центр биотехнологии
  • G. Zh. Sharipova РГП «Национальный центр биотехнологии
  • N. B. Moldagulova РГП «Национальный центр биотехнологии
  • A. B. Shevtsov РГП «Национальный центр биотехнологии
        48 34

Keywords:

psikhrofilny microorganisms, identification, nucleotide sequence

Abstract

The results of the psikhrofilny petroleumoxidizing microorganisms identification are presented in this article. This microorganisms were allocated from territories of the West Kazakhstan , with the method of direct nucleotide sequence m 16 S RNA determination.

References

1. Стабникова Е.В., Селезнева М.В., Рева О.Н., Иванов В.Н. Выбор активного микроорганизма- деструктора углеводородов для очистки нефтезагрязненных почв // Прикладная биохимия и микробиология. - 1995. - № 5. - С. 534-539.
2. Дудикова Г.Н., Яушева Т.В., Кудрякова А.В., Жолдыбаева Е.В., Шевцов А.Б. Генетическая идентификация молочнокислых бактерий на основе анализа нуклеотидной последовательности // Био- технология. Теория и практика. №3 2012. С.55-56
3. Clayton R. A., Sutton G., Hinkle P. S., Bult Jr. C., Fields C.. 1995. Intraspecific variation in smallsubunit rRNA sequences in GenBank: why single sequences may not adequately represent prokaryotic taxa //
International Journal of Systematic Bacteriology. – 1995. – Vol. 45. – P. 595–599.
4. Zhang Q., Kennon R., Koza M. A., Hulten K., Clarridge III J. E.. 2002. Pseudoepidemic due to a unique strain of Mycobacterium szulqai: genotypic, phenotypic, and epidemiological analysis // Journal of
Clinical Microbiology. – 2002. – Vol. 40. – P. 1134–1139.
5. Куйбагаров М.А., Шевцов А.Б., Жумалин А.Х., Карибаев Т.Б., Аканова А.А., Шевцова Е.С. Генетическая идентификация бактерий коллекционных штаммов на основе проведения анализа нуклеотидной последовательности 16S RNA гена// Вестник науки Казахского Агротехнического университета им.С.Сейфуллина.- 2013 №2(77). С.14-20
6. www.ncbi.nlm.gov/BLAST/
7. Kumar S., Tamura K., Nei M. MEGA3: Integrated software for Molecular Evolutionary Genetics
Analysis and sequence alignment // Briefings in bioinformatics. – 2004. – Vol. 5, №2. – P. 150–163. Y11330 K.erythromyxa strain Zhn-1
X87756 Kocuria rosea AY987383 Kocuria himachalensis AJ278868 Kocuria polaris DQ059617 Kocuria aegyptia Y16264 Kocuria rhizophila
EF602041 Kocuria flava DQ531634 Kocuria turfanensis 0.002

Downloads

How to Cite

Khassenova, E. Z., Sharipova, G. Z., Moldagulova, N. B., & Shevtsov, A. B. (2015). Identification of psikhrofilny petroleumoxidizing microorganisms on the basis of direct nucleotide sequence 16 S RNA identification. Experimental Biology, 60(2), 402–406. Retrieved from https://bb.kaznu.kz/index.php/biology/article/view/985