Характеристики взаимодействия miR-1322 c mRNA генов, участвующих в развитии рака молочной железы

D. Aisina; E. Imyanitov; A. Ivashchenko

Авторы

D. Aisina Научно-исследовательского института проблем биологии и биотехнологии Казахского национального университета имени аль-Фараби, Казахстан, г. Алматы
E. Imyanitov Национальный медицинский исследовательский центр онкологии имени Н.Н. Петрова, Санкт-Петербург , Россия
A. Ivashchenko Научно-исследовательский институт проблем биологии и биотехнологии Казахского национального университета имени аль-Фараби, Казахстан, г. Алматы

Ключевые слова:

miR-1322; mRNA; онкогенез; рак молочной железы; ортологичные гены.

Аннотация

Работа посвящена нахождению сайтов связывания miR-1322 в mRNA кандидатных генов AFF3, AR, ARID3B, E2F4, NCOA3, NCOR2, SMARCA2, участвующих в развитии рака молочной железы. В mRNA гена AFF3 человека выявлены два полисайта связывания miR-1322 кодирующих полисерины. Три полисайта связывания miR-1322 в mRNA гена AR кодировали полиглутамины. Два полисайта связывания miR-1322 в mRNA гена ARID3B человека кодировали два полиглутамина. mRNA ортологичных генов NCOA3 содержала от 10 до 15 сайтов связывания miR-1322. Сайты связывания mir-1322 c mRNA гена E2F4 кодировали полисерин. mRNA ортологичных генов NCOA3 содержала от 10 до 15 сайтов связывания miR-1322. Ортологичные гены NCOR2 кодировали полиглутамин, характеристики взаимодействия mir-1322 c mRNA были близки. Все сайты связывания miR-1322 с mRNA гена SMARCA2 кодировали полиглутамин и имели одинаковые характеристики взаимодействия. Все полисайты связывания miR-1322 в mRNA всех ортологичных генов были фланкированы консервативными нуклеотидными последовательностями. Характеристики связывания miR-1322 с mRNA всех ортологичных генов были близкими. miR-1322 вместе с этими генами можно использовать в качестве маркеров для ранней диагностики рака молочной железы и других онкологических заболеваний.

Биографии авторов

D. Aisina, Научно-исследовательского института проблем биологии и биотехнологии Казахского национального университета имени аль-Фараби, Казахстан, г. Алматы

студент PhD-докторантуры, стажер-исследователь Научно-исследовательского института проблем биологии и биотехнологии Казахского национального университета имени аль-Фараби, Казахстан, г. Алматы
E. Imyanitov, Национальный медицинский исследовательский центр онкологии имени Н.Н. Петрова, Санкт-Петербург , Россия

доктор медицинских наук, профессор, член-корр. РАН, заведующий отдела биологии опухолевого роста Национального медицинского исследовательского центра онкологии имени Н.Н. Петрова, Россия, г. Санкт-Петербург