Поиск воспроизводимых независимых компонент в транскриптомах пациентов с раком молочной железы. Сүт безі ісігімен ауыратын пациенттердің транскриптомаларында қалпына келтірілетін тəуелсіз компоненттерді іздеу

U. Ye. Kairov; A. Yu. Zinovyev; T. A. Karpenyuk; Ye. M. Ramanculov

Authors

U. Ye. Kairov Казахский национальный университет им. аль-Фараби, Казахстан, г. Алматы; Национальный центр биотехнологии РК, Казахстан, г. Астана;
A. Yu. Zinovyev Институт Кюри, Франция, Париж
T. A. Karpenyuk Казахский национальный университет им. аль-Фараби, Казахстан, г. Алматы
Ye. M. Ramanculov Национальный центр биотехнологии РК, Казахстан, г. Астана

Keywords:

breast cancer, independent component analysis, correlation graphs of gene expression, gene interactions, signaling pathways,

Abstract

The technique with using of Independent component analysis for searching of reproducible independent components from Affymetrix HG-U133A array transcriptomes of patients with breast cancer has been developed. This technique can be used to construct correlation graphs of gene expression, to reveal gene interactions and new signaling pathways specifi c to cancer.