Қазақстанның перспективті жүзім сорттарына SSR микросателлитті маркерлері арқылы жүргізілген молекулалық-генетикалық мінездеме. Молекулярно-генетическая характеристика перспективных казахстанских сортов винограда по SSR микросателлитным маркерам
Ключевые слова:
жүзім, генотипирлеу, ssr маркерлер, ДНҚ, ПТР, виноград, генотипирование, SSR маркеры, ДНК, ПЦР,Аннотация
Бұл жұмыста қазақстанның перспективті жүзім сорттарына кономикалық тұрғыдан тиімді, генотипирлеу әдісі таңбаланбаған спецификалық тиісті жұп праймерлерді және әр түрлі флуоресцентті бояғыштармен таңбаланған үш әмбебап олигонуклеотидтерді пайдалану арқылы 6 микросателлитті маркерлер қолданылған және оңтайландырылған.VVS2 ,VVMD5, VVMD7, VVMD27, ssrVrZAG62 және ssrVrZAG79 6 микросателлитті локустармен жүргізілген сараптама, қазақстан сорттарының «ұрпақ – ата-ана» байланысын дәлелдеді. Осы игерілген және оңтайландырылған әдіс Қазақстандағы барлық жүзім дақылдарының тектік қорын генетикалық сәйкестендіру және тӛлқұжаттау үшін қолданылатын болады. В настоящей работе применена для винограда экономически выгодная методика генотипирования по 6 микросателлитным маркерам с использованием соответствующих пар немеченых специфических праймеров и трѐх универсальных олигонуклеотидов, меченых различными флуоресцентными красителями. Данная методика использована для генотипирования ряда перспективных казахстанских сортов и их родительских форм. Анализ, проведенный по используемому исследователями винограда набору из 6-и микросаттелитных маркеров: VVS2 ,VVMD5, VVMD7, VVMD27, ssrVrZAG62 и ssrVrZAG79 подтвердил для казахстанских сортов отношения «потомок – родитель». Освоенный и оптимизированный метод будет использован для генетической идентификации и паспортизации всего генофонда культуры винограда в Казахстане.Библиографические ссылки
1 Ganal M.W., Polley A., Graner E.M., Plieske J., Wieseke R., Luerssen H., Durstewitz G. Large SNParrays for genotyping in crop plants // J Biosci. – 2012. –V.37. – P.821-828.
2 Miedaner T., Korzun V. Marker-assisted selection for disease resistance in wheat and barley breeding. Phytopathology. – 2012. –V. 102. – P. 560-566.
3 Paux E., Sourdille P., Mackay I., Feuillet C. Sequence-based marker development in wheat: advances and applications to breeding //Biotechnol Adv. – 2012. –V. 30. –P. 1071-1088.
4 Powel W., Machray G.C., Provan J. Polymorphism revealed by simple sequence repeats // Trends Plant Sci.–1996. –V. 1.–P. 215-222.
5 Doyle J.J. and Doyle JL. Isolation of plant DNA from fresh tissue // Focus. –1990.–Vol.12.–P.13-15
6 AubakirovaK., OmashevaM., RyabushkinaN., Tazhibaev T., Kampitova G., GaliakparovN. Evaluation of five protocols for DNA extraction from leaves of Malussieversii, Vitis vinifera, and Armeniaca vulgaris // GMR. –accepted.
7 This P., Jung A., Boccacci P., Borrego J., Botta R., Costantini L., Crespan M.,. Dangl . C. Eisenheld F. Ferreira-Monteiro . S. Grando . J. Iba.n˜ ez T. Lacombe . V. Laucou . R. Magalha˜ es G.S., Meredith C.P., Milani N., Peterlunger E., Regner F., Zulini L., Maul E. Development of a standard set of microsatellite reference alleles for identification of grape cultivars // Theor Appl Genet.– 2004. –Vol.109. –P.1448-1458 doi: 10.1007/s00122-004-1760-3 PMID: 15565426
8 Аубакирова К.П., Омашева М.Е., Рябушкина Н.А., Береснева Л.В.,ГалиакпаровН.Н. Использование универсальных флуоресцентно-меченых праймеров в генотипировании казахстанских сортов винограда по микросателлитным маркерам// Биотехнология теория и практика.-2013. – №2.- С.35-41.
2 Miedaner T., Korzun V. Marker-assisted selection for disease resistance in wheat and barley breeding. Phytopathology. – 2012. –V. 102. – P. 560-566.
3 Paux E., Sourdille P., Mackay I., Feuillet C. Sequence-based marker development in wheat: advances and applications to breeding //Biotechnol Adv. – 2012. –V. 30. –P. 1071-1088.
4 Powel W., Machray G.C., Provan J. Polymorphism revealed by simple sequence repeats // Trends Plant Sci.–1996. –V. 1.–P. 215-222.
5 Doyle J.J. and Doyle JL. Isolation of plant DNA from fresh tissue // Focus. –1990.–Vol.12.–P.13-15
6 AubakirovaK., OmashevaM., RyabushkinaN., Tazhibaev T., Kampitova G., GaliakparovN. Evaluation of five protocols for DNA extraction from leaves of Malussieversii, Vitis vinifera, and Armeniaca vulgaris // GMR. –accepted.
7 This P., Jung A., Boccacci P., Borrego J., Botta R., Costantini L., Crespan M.,. Dangl . C. Eisenheld F. Ferreira-Monteiro . S. Grando . J. Iba.n˜ ez T. Lacombe . V. Laucou . R. Magalha˜ es G.S., Meredith C.P., Milani N., Peterlunger E., Regner F., Zulini L., Maul E. Development of a standard set of microsatellite reference alleles for identification of grape cultivars // Theor Appl Genet.– 2004. –Vol.109. –P.1448-1458 doi: 10.1007/s00122-004-1760-3 PMID: 15565426
8 Аубакирова К.П., Омашева М.Е., Рябушкина Н.А., Береснева Л.В.,ГалиакпаровН.Н. Использование универсальных флуоресцентно-меченых праймеров в генотипировании казахстанских сортов винограда по микросателлитным маркерам// Биотехнология теория и практика.-2013. – №2.- С.35-41.
Загрузки
Как цитировать
Aubakirova, K. P., Omasheva M. Е., Ryabushkina N. А., Tazhibaev Т. S., Suyunbaeva G. М., & Galiakparov, N. N. (2015). Қазақстанның перспективті жүзім сорттарына SSR микросателлитті маркерлері арқылы жүргізілген молекулалық-генетикалық мінездеме. Молекулярно-генетическая характеристика перспективных казахстанских сортов винограда по SSR микросателлитным маркерам. Вестник КазНУ. Серия биологическая, 60(1), 186–190. извлечено от https://bb.kaznu.kz/index.php/biology/article/view/91
Выпуск
Раздел
БИОИНЖЕНЕРИЯ РАСТЕНИЙ