Метагеномный анализ микробного сообщества в образцах казахстанского угля с использованием технологии секвенирования нового поколения Illumina
DOI:
https://doi.org/10.26577/eb-2018-3-1338Аннотация
В последние годы все большее внимание уделяется разработке биотехнологических процессов для утилизации ископаемых энергоресурсов. Как известно, в Казахстане достаточно угольных ресурсов, в том числе, низкокачественных бурых и окисленных бурых углей. Бурые угли (лигниты) не находят широкого применения в промышленности из-за их низкой энергетической ценности. В то же время, они являются наиболее богатыми источниками гуминовых веществ (ГВ), и потому играют важную роль в физико-химических процессах, происходящих в таких процессах, как улавливание и стабилизация углерода, инактивация пестицидов, тяжелых металлов и других загрязняющих веществ. Биообработка лигнита также включает производство чистой энергии.
Изучение микробного разнообразия углей является общей задачей экологической и прикладной микробиологии для эффективного использования угольных ресурсов. Доказано, что до 99% микроорганизмов, обитающих в природных условиях, не способны расти на питательных средах in vitro, используемых в лабораторной практике. В настоящее время имеются огромные возможности в использовании некультуральных методов, основанных на омикс-технологиях для изучения микробного разнообразия объектов окружающей среды, таких как почва, осадки, минералы и т.д.
В данной работе представлены и обсуждаются результаты микробного разнообразия проб угля казахстанских угольных месторождений, в которых применяется платформа технологии Illumina NGS. По результатам метагеномного анализа образцов угля (Ойкарагай, Ленгер, Караганда, Экибастуз) были идентифицированы и проанализированы 10 таксономических групп бактерий, принадлежащие к Proteobacteria, Tenericutes, Actinobacteria, Firmicutes, Bacteroidetes, Nitrospirae, Chloroflexi, Gemmatimonadetes, Acidobacteria и Fusobacteria.
Ключевые слова: бурый уголь, окисленный уголь, микробное разнообразие, микробное сообщество, метагеномика, секвенирование Illumina Miseq
