Использование методов современной метагеномики в оценке микробиоты почв Западно-Казахстанской области.  Батыс Қазақстан облысы топырақтарының микробиота жағдайын бағалауда заманауи метагеномика әдістерін қолдану

N. H. Sergaliev; E. E. Andronov; A. G. Pinaev; M. G. Kakishev; R. A. Zaharyan

Автор(и)

N. H. Sergaliev Западно-Казахстанский аграрно-технический университет имени Жангир хана
E. E. Andronov Всероссийский научно-исследовательский институт сельскохозяйственной микробиологии
A. G. Pinaev Всероссийский научно-исследовательский институт сельскохозяйственной микробиологии
M. G. Kakishev Западно-Казахстанский аграрно-технический университет имени Жангир хана
R. A. Zaharyan Западно-Казахстанский аграрно-технический университет имени Жангир хана

Ключові слова:

микробиома, почвенные микроорганизмы, ПЦР, секвенирование, таксономия, тип почвы, ДНК, агроэкология, мониторинг, молекулярная биология. микробиома, топырақ микрорганизмдері, ПТР, секвенирлеу, таксономиялық, топырақ типтері, ДНҚ, мониторинг.

Анотація

В данной статье приведена методика по оценке микробиома почв с применением методов современной ме- тагеномики. Описан метод очистки почвенной ДНК с использованием сорбции на очищенном кремнии. Вы- явлены данные по оптимизации условий ПЦР и подбору праймеров. Для оценки метагенома почвы составлена ампликонная библиотека и проведен ее первичный анализ. Выявлены наиболее преобладающие филы в данных образцах почв. Мақалада заманауи метагеномика әдістерін колдану арқылы топырақ микробиомасын бағалау әдістері келтірілген. Тазаланған кремний негізіндегі сорбция қолдану арқылы топырақ ДНҚ тазалау әдісі көрсетілген.Топырақ метагеномын бағалау үшін ампликондық библиотека жасақталып оның алғашқы талдауы өткiзiлген, ПТР жағдайларын оңтайландыру және праймерлер таңдау бойынша мәліметтер алынған. Топырақ сынамаларындағы басым филдар анықталды.