Молекулярно-генетический анализ новых изолятов вируса гриппа птиц субтипа Н3N8, выделенных в северных регионах Казахстана
DOI:
https://doi.org/10.26577//eb.2020.v82.i1.10Аннотация
Молекулярно-генетический анализ генов вирусных изолятов позволит оценить распространение вируса гриппа А на территории Республики Казахстан. Контроль за гриппом птиц затруднен из-за высокой изменчивости генома вируса. Рaспространение вирусов гриппа среди диких водоплавающих птиц и мест их обитания представляет собой потенциальную угрозу для здоровья населения. В настоящее время возбудитель гриппа является объектом детального изучения, особенно в плане генетической паспортизации штаммов, используемых для разработки диагностических и профилактических средств.
Целью исследования является изучение молекулярно-генетических свойств новых изолятов вируса гриппа птиц субтипа Н3N8, выделенных во время мониторинга гриппа птиц в северных регионах Казахстана. При выполнении исследований были использованы современные методы молекулярной биологии и генной инженерии.
В 2018 году во время вирусологического мониторинга диких птиц в северных регионах Казахстана были выявлены особи, инфицированные вирусом гриппа А. Клоачные смывы двух птиц, в частности широконоски (Anas clypeata) и чирка-трескунка (Anas querquedula) показали положительную реакцию на вирус гриппа типа А субтипа H3N8 методом ПЦР.
В результате исследовании получены изоляты вируса гриппа А/широконоска/СКО/20/2018 (H3N8) и А/чирок-трескунок/СКО/45/2018 (H3N8).
Показаны результаты определения нуклеотидных последовательностей и филогенетического анализа важных генов новых изолятов А/широконоска/СКО/20/2018 (H3N8) и А/чирок-трескунок/СКО/45/2018 (H3N8) вируса гриппа птиц. Новые казахстанские изоляты вируса гриппа птиц по составу М-гена наибольшее родство проявляют со штаммами вируса гриппа птиц субтипа H3N8, выделенными в Монголии в 2018 г.
Результаты молекулярно-генетического анализа новых изолятов вируса гриппа птиц субтипа Н3N8, выделенных в северных регионах Казахстана будут использованы в производстве нового поколения вакцин, диагностикумов и разработке мероприятий по улучшению эпизоотической обстановки по гриппу в Республике Казахстан.
Ключевые слова: генетический анализ, вирус гриппа птиц, дикие птицы, ПЦР, РНК.
