Использование методов современной метагеномики в оценке микробиоты почв Западно-Казахстанской области.  Батыс Қазақстан облысы топырақтарының микробиота жағдайын бағалауда заманауи метагеномика әдістерін қолдану

N. H. Sergaliev; E. E. Andronov; A. G. Pinaev; M. G. Kakishev; R. A. Zaharyan

Authors

N. H. Sergaliev Западно-Казахстанский аграрно-технический университет имени Жангир хана
E. E. Andronov Всероссийский научно-исследовательский институт сельскохозяйственной микробиологии
A. G. Pinaev Всероссийский научно-исследовательский институт сельскохозяйственной микробиологии
M. G. Kakishev Западно-Казахстанский аграрно-технический университет имени Жангир хана
R. A. Zaharyan Западно-Казахстанский аграрно-технический университет имени Жангир хана

Keywords:

microbiome, soil microorganisms, PCR, sequencing, taxonomy, soil type, DNA, agroecology, monitoring, molecular biology

Abstract

This article describes a method to assess the soil microbiome with application of modern metagenomics. The method to clean soil DNA using adsorption on purified silicon. Identified data for optimization of PCR primer design. To assess the soil metagenome library composed of amplicons and held its initial analysis. Revealed the most prevalent phyla in these soil samples.