ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ КАЗАХСКОЙ ГРУБОШЁРСТНОЙ ОВЦЫ
DOI:
https://doi.org/10.26577//bb108320268Ключевые слова:
филогенетика, секвенирование, генетическое разнообразие, D-петля, ДНК-маркеры, SNP50, ПЦРАннотация
В данном исследовании был проведен филогенетический анализ для определения генетического разнообразия казахской курдючной грубошерстной породы овец, разводимой в Казахстане, с использованием SNP-полиморфизмов D-петли митохондриальной ДНК (мтДНК) длиной 840 пар оснований (п.н.). Всего из популяции были случайным образом отобраны 80 овец. Из периферической крови выделяли ДНК, после чего проводили амплификацию методом полимеразной цепной реакции (ПЦР). В результате секвенирования амплифицированных продуктов был определен нуклеотидный состав: 31,46% аденина, 36,19% тимина, 16,42% гуанина и 15,93% цитозина. Полученные последовательности сравнивали с доступными в базе данных NCBI нуклеотидными последовательностями домашних овец и диких муфлонов. Филогенетический анализ, проведенный с использованием MEGA X, показал, что последовательности казахской курдючной грубошерстной породы овец образуют отдельный кластер с высокой статистической поддержкой bootstrap 98–100%, что свидетельствует о четкой генетической дифференциации от референсных популяций овец, включенных в анализ. Кроме того, казахская курдючная грубошерстная порода овец продемонстрировала близкое генетическое родство с монгольской, тибетской и гиссарской породами овец. В отличие от них, европейские породы овец располагались на большем генетическом расстоянии на филогенетическом дереве, что указывает на их принадлежность к различным эволюционным линиям.
