ХАРАКТЕРИСТИКИ СВЯЗЫВАНИЯ miR414 С mRNA ГЕНОВ ХРОМОСОМЫ 4 Arabidopsis thaliana

Авторы

  • А. А. Бари Казахский национальный университет имени аль-Фараби
  • В. А. Хайленко Казахский национальный университет имени аль-Фараби
  • А. Т. Иващенко Казахский национальный университет имени аль-Фараби

Ключевые слова:

miR414, mRNA, ген, хромосома,

Аннотация

Выявлены характеристики связывания miR414 с mRNA 236 генов хромосомы 4 Аrabidopsis thaliana. Установлены существенные отличия mRNA изученных генов по числу сайтов связывания и энергии взаимодействия с miR414. Аrаbidорsis thaliana 4 хромосомасының 236 ген mRNAмен miR414тiң байланыс сипаттамасы анықталған. Зерттелген гендер mRNAмен miR414тің байланыс сайт саны жəне өзара əрекеттесу энергиясы бойынша маңызды айырмашылықтар табылған.

Библиографические ссылки

1. Song Q.-X., Liu Y.-F., Hu X.-Y., Zhang W.-K., Ma B., Chen S.-Y., Zhang J.-S. Identification of miRNAs and their target genes in developing soybean seeds by deep sequencing // BMC Plant Biology, 2011, V.11, P.5-21.

2. Ivashuta S., Banks I., Wiggins B., Zhang Y., Ziegler T., Roberts J., Heck G. Regulation of gene expression in plants through miRNA inactivation // PLoS ONE, 2011, V.6, P.e21330.

3. Todesco M., Rubio-Somoza I., Paz-Ares J., Weigel D. A collection of target mimics for comprehensive analysis of microRNA function in Arabidopsis thaliana // PLoS Genet., 2010, V. 6, P.e1001031.

4. Schwab R., Palatnik J., Riester M., Schommer C., Schmid M., Welgel D. Specific effects of microRNAs on the plant transcriptome // Develop. Cell, 2005, V.8, P.517-527.

5. Axtell M., Bartel D. Antiquity of MicroRNAs and their targets in land plants // Plant Cell, 2005, V.17, P.1658-1673.

6. Jones-Rhoades M., Bartel D. MicroRNAs and their regulatory roles in plants // Ann.Rev. Plant Biol., 2006, V.57, P.19-53.

7. Nair S., Wang N., Turuspekov Y., Pourkheirandish M. et al. Cleistogamous flowering in barley arises from the suppression of microRNA-guided HvAP2 mRMA cleavage // PNAS USA, 2010, V.107, P.490-496.

8. Bartel D. MicroRNAs: target recognition and regulatory functions // Cell 2009, V.136, P.215-233.

9. Willmann M., Mehalick A., Packer R., Jenik P. MicroRNAs regulate the timing of embryo maturation in Arabidopsis // Plant Physiology, 2011, V.155, P.1871-1884.

10. Nodine M., Bartel D. MicroRNAs prevent precocious gene expression and enable pattern formation during plant embryogenesis. // Genes Dev., 2010, V.24, P.2678–2692.

11. Buhtz A., Pieritz J., Springer F, Kehr J. Phloemsmall RNAs, nutrient stress responses, and systemic mobility // BMC Plant Biol., 2010, V.10, P.64-68.

12. Kant S., Peng M., Rothstein S. Genetic regulation by NLA and microRNA827 for maintaining nitrate-dependent phosphate homeostasis in Arabidopsis // PLoS Genet., 2011, V.7, P.e1002021.

13. Valdeґs-Loґpez O., Yang S., Aparicio-Fabre R., Graham P., Reyes J., Vance C., Hernaґndez G. MicroRNA expression profile incommon bean (Phaseolus vulgaris) under nutrient deficiency stresses and manganese toxicity // New Phytol., 2010, V.187,P.805-818.

14. Ding Y., Chen Z., Zhu C. Microarray-based analysis of cadmium-responsive microRNAs in rice (Oryza sativa) // Journal Exper. Botany, 2011, P.1-11, doi:10.1093/jxb/err046.

15. Khraiwesh B., Zhu J.-K., Zhu J. Role of miRNAs and siRNAs in biotic and abiotic stress responses of plants // Bioch. Biophys. Acta, 2011, doi:10.1016/j.bbagrm.2011.05.001

16. Kuo H.-F., Chiou T.-J. The role of microRNAs in phosphorus deficiency signaling // Plant Physiology, 2011, V.156, P.1016-1024.

17. Sunkar R. MicroNRAs with macro-effect on plant stress responses // Seminars in Cell and Devel. Biol., 2010, V.21, P.805-811.

18. Sunkar R., Chinnusamy V., Zhu J., Zhu J.-K. Small RNAs as big players in plant abiotic stress responses and nutrient deprivation // TRENDS in Plant Science, 2007, V.12. P.301-309.

19. Devers E., Branscheid A., May P., Krajinsk F. Stars and symbiosis: microRNA- and microRNA*-mediated transcript cleavage involved in arbuscular mycorrhizal symbiosis // Plant Physiology, 2011, V.156, P.1990-2010.

20. Бари А., Атaмбаева Ш., Оразова С., Бакенова Д., Иващенко А. МикроРНК при стрессе у растений // Вестник КазНУ им.аль-Фараби, серия биол., 2011, №4(50), С.34-37.

Загрузки

Выпуск

Раздел

Физико-химическая биология

Наиболее читаемые статьи этого автора (авторов)

1 2 > >>